RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.98■■■□□ 2.23
TMOD3-203ENST00000558455 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.97■■■□□ 2.23
TMOD3-203ENST00000558455 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.97■■■□□ 2.23
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC6O95255 1503 aa28.95■■■□□ 2.23
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0G2JS52 829 aa28.94■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 MYT1Q01538 1121 aa28.94■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 USP35Q9P2H5 1018 aa28.94■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.94■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.93■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 LTN1O94822 1766 aa28.91■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 CRB1P82279 1406 aa28.91■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.9■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 PANK3Q9H999 370 aa28.9■■■□□ 2.22
TMOD3-203ENST00000558455 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
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TMOD3-203ENST00000558455 RGPD5Q99666 1765 aa28.88■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.88■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.88■■■□□ 2.21
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TMOD3-203ENST00000558455 BARGINQ6ZT62 677 aa28.87■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.87■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.86■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.85■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.85■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 ERBB3P21860 1342 aa28.83■■■□□ 2.21
TMOD3-203ENST00000558455 EP400Q96L91 3159 aa28.83■■■□□ 2.21
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TMOD3-203ENST00000558455 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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TMOD3-203ENST00000558455 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.79■■■□□ 2.2
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TMOD3-203ENST00000558455 AMPHP49418 695 aa28.79■■■□□ 2.2
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.79■■■□□ 2.2
TMOD3-203ENST00000558455 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.79■■■□□ 2.2
TMOD3-203ENST00000558455 RTL1A6NKG5 1358 aa28.78■■■□□ 2.2
TMOD3-203ENST00000558455 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.75■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 FAM182BQ5T319 152 aa28.73■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.73■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.73■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 NSD2O96028 1365 aa28.73■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 PEAK1Q9H792 1746 aa28.72■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.71■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 DISP2A7MBM2 1401 aa28.71■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.71■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC37A3O60309 1634 aa28.7■■■□□ 2.19
TMOD3-203ENST00000558455 FLT4P35916 1363 aa28.7■■■□□ 2.18
TMOD3-203ENST00000558455 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.7■■■□□ 2.18
TMOD3-203ENST00000558455 PDE3BQ13370 1112 aa28.69■■■□□ 2.18
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TMOD3-203ENST00000558455 MORC1Q86VD1 984 aa28.63■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.62■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 IL2RBP14784 551 aa28.61■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 TNS2Q63HR2 1409 aa28.6■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
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TMOD3-203ENST00000558455 NBPF4Q96M43 638 aa28.59■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.58■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.58■■■□□ 2.17
TMOD3-203ENST00000558455 EXOC5O00471 708 aa28.57■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
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TMOD3-203ENST00000558455 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.55■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM37O94972 964 aa28.54■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.54■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.53■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.52■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 MEGF6O75095 1541 aa28.52■■■□□ 2.16
TMOD3-203ENST00000558455 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 BCL9O00512 1426 aa28.49■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 BAG6P46379 1132 aa28.48■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 NCAPD2Q15021 1401 aa28.47■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.46■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 EYA1Q99502 592 aa28.46■■■□□ 2.15
TMOD3-203ENST00000558455 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
TMOD3-203ENST00000558455 APBA3O96018 575 aa28.42■■■□□ 2.14
TMOD3-203ENST00000558455 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TMOD3-203ENST00000558455 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TMOD3-203ENST00000558455 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TMOD3-203ENST00000558455 SBF2Q86WG5 1849 aa28.41■■■□□ 2.14
TMOD3-203ENST00000558455 MTHFSP49914 203 aa28.4■■■□□ 2.14
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