RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	AMPH	P49418	695 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	PDE3B	Q13370	1112 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	IP6K1	Q92551	441 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	USP35	Q9P2H5	1018 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	PIK3C2A	O00443	1686 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	CRB1	P82279	1406 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	ABCC6	O95255	1503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PSEN1-222	ENST00000557356	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	POTED	Q86YR6	584 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	PANK3	Q9H999	370 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	GLI3	P10071	1580 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	CCDC7	Q96M83	1385 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	NFAT5	O94916	1531 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	USP54	Q70EL1	1684 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	EXOC5	O00471	708 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	HOXC9	P31274	260 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	DDB1	Q16531	1140 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	ERBB3	P21860	1342 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	RTL1	A6NKG5	1358 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	NSD2	O96028	1365 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	MORC1	Q86VD1	984 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	IL2RB	P14784	551 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	FLT4	P35916	1363 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	BAG6	P46379	1132 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
PSEN1-222	ENST00000557356	COL18A1	P39060	1754 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	INSR	P06213	1382 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	FBLN1	P23142	703 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	POLK	Q9UBT6	870 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	MYOM1	P52179	1685 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	TRIM37	O94972	964 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	BCL9	O00512	1426 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	APBA3	O96018	575 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM182B	Q5T319	152 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PSEN1-222	ENST00000557356	LTN1	O94822	1766 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		10.65	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	PLSCR1	O15162	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71	6e-6	■□□□□ 8.9
PSEN1-222	ENST00000557356	SPG7	Q9UQ90	795 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	RGPD5	Q99666	1765 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	TNS2	Q63HR2	1409 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	MTHFS	P49914	203 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	EYA1	Q99502	592 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	CFAP53	Q96M91	514 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PSEN1-222	ENST00000557356	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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