RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 PANK3Q9H999 370 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 LRRC37A3O60309 1634 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 FBLN1P23142 703 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 COG3Q96JB2 828 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 STRN4Q9NRL3 753 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 VPS72Q15906 364 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-211ENST00000548041 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
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CS-211ENST00000548041 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 CRB1P82279 1406 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 SBF2Q86WG5 1849 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 EVA1CP58658 441 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 USP35Q9P2H5 1018 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 RTL1A6NKG5 1358 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 NSD2O96028 1365 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 ERBB3P21860 1342 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-211ENST00000548041 A0A0G2JS52 829 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 HOXC9P31274 260 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 MYT1Q01538 1121 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 IP6K1Q92551 441 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 FLT4P35916 1363 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 SOCS7O14512 581 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 AMPHP49418 695 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 DISP2A7MBM2 1401 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 BARGINQ6ZT62 677 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 MORC1Q86VD1 984 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 POLKQ9UBT6 870 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 INSRP06213 1382 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 MEGF6O75095 1541 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 FAM182BQ5T319 152 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 TNS2Q63HR2 1409 aa11.77□□□□□ -0.52
CS-211ENST00000548041 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 NHSQ6T4R5 1651 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 NBPF4Q96M43 638 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 NCAPD2Q15021 1401 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 ITGB4P16144 1822 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 BTAF1O14981 1849 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 RREB1Q92766 1687 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 IL2RBP14784 551 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 DDB1Q16531 1140 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 PDE3BQ13370 1112 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-211ENST00000548041 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.71□□□□□ -0.54
CS-211ENST00000548041 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-211ENST00000548041 MTHFSP49914 203 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-211ENST00000548041 EYA1Q99502 592 aa11.7□□□□□ -0.54
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