RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543505.5

PGA3-208, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-208ENST00000543505 UTRNP46939 3433 aa15.04■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 ZBTB7AO95365 584 aa15.04■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 DDB1Q16531 1140 aa15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 CABP1Q9NZU7 370 aa15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 MYOM1P52179 1685 aa15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 NLRP6P59044 892 aa15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 SLIT3O75094 1523 aa15.02■□□□□ -0
PGA3-208ENST00000543505 RGPD5Q99666 1765 aa15.02□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.02□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.01□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.01□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.01□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 USP6P35125 1406 aa15.01□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 PIK3C2AO00443 1686 aa15□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.99□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.99□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 TXNRD1Q16881 649 aa14.99□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 AKAP12Q02952 1782 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 SYT17Q9BSW7 474 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 BCL9O00512 1426 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 SOX12O15370 315 aa14.96□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 SLC15A2Q16348 729 aa14.96□□□□□ -0.01
PGA3-208ENST00000543505 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.95□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 STK32BQ9NY57 414 aa14.94□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.93□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 EXOC5O00471 708 aa14.92□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.92□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.92□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 NFAT5O94916 1531 aa14.91□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 MTFR1LQ9H019 292 aa14.91□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 CHD4Q14839 1912 aa14.9□□□□□ -0.02
PGA3-208ENST00000543505 ZNF827Q17R98 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 PAPPAQ13219 1627 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 NHSQ6T4R5 1651 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 ARXQ96QS3 562 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 TNS2Q63HR2 1409 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.87□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 EVC2Q86UK5 1308 aa14.87□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.86□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 C1QTNF8P60827 252 aa14.86□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 BTAF1O14981 1849 aa14.86□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 CCDC7Q96M83 1385 aa14.86□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.85□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 MIER1Q8N108 512 aa14.84□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.84□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 ABCC6O95255 1503 aa14.84□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.83□□□□□ -0.03
PGA3-208ENST00000543505 KCNQ4P56696 695 aa14.83□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.83□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 ERBB3P21860 1342 aa14.83□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 NME9Q86XW9 330 aa14.82□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 AKT1S1Q96B36 256 aa14.82□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 MAP3K5Q99683 1374 aa14.82□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.82□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 LTN1O94822 1766 aa14.81□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 IL2RBP14784 551 aa14.81□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.81□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 USP31Q70CQ4 1352 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 NEUROD1Q13562 356 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 GPR162Q16538 588 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 KLHL34Q8N239 644 aa14.78□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 USP54Q70EL1 1684 aa14.78□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 CEP350Q5VT06 3117 aa14.78□□□□□ -0.04
PGA3-208ENST00000543505 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.77□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.76□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.76□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 TONSLQ96HA7 1378 aa14.75□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PGA3-208ENST00000543505 FBLN1P23142 703 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms