RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	SPINT1	O43278	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	KRT76	Q01546	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	PTS	Q03393	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CBLB	Q13191	982 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	RASSF7	Q02833	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	GDF11	O95390	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ITGA6	P23229	1130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	PTK2	Q05397	1052 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	NR6A1	Q15406	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	RELB	Q01201	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ADAM32	Q8TC27	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	LILRA1	O75019	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ADH1A	P07327	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	CDC14C	A4D256	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ESPN	B1AK53	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	AP1G2	O75843	785 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	PTGIR	P43119	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCNC-208	ENST00000519617	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	IGHA1	P01876	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	IRS1	P35568	1242 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	RAB15	P59190	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	GAS6	Q14393	721 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	TRIM52	Q96A61	297 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CCNC-208	ENST00000519617	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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