RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515209.5

LMAN2-208, Transcript of lectin, mannose binding 2, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene LMAN2, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMAN2-208	ENST00000515209	FYB1	O15117	783 aa		33.22	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.22	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.21	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	COG3	Q96JB2	828 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.2	■■■□□ 2.91
LMAN2-208	ENST00000515209	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.19	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	EVA1C	P58658	441 aa		33.17	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	CRB1	P82279	1406 aa		33.17	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		33.16	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.15	■■■□□ 2.9
LMAN2-208	ENST00000515209	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.12	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	PANK3	Q9H999	370 aa		33.1	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.08	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.08	■■■□□ 2.89
LMAN2-208	ENST00000515209	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.07	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.06	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	ERBB3	P21860	1342 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.05	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	FBLN1	P23142	703 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	IP6K1	Q92551	441 aa		33.04	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.02	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209	NSD2	O96028	1365 aa		33.01	■■■□□ 2.88
LMAN2-208	ENST00000515209		A0A0G2JS52	829 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	MYT1	Q01538	1121 aa		33.01	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	HOXC9	P31274	260 aa		32.99	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.98	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.97	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.97	■■■□□ 2.87
LMAN2-208	ENST00000515209	AMPH	P49418	695 aa		32.94	■■■□□ 2.86
LMAN2-208	ENST00000515209	FLT4	P35916	1363 aa		32.93	■■■□□ 2.86
LMAN2-208	ENST00000515209	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LMAN2-208	ENST00000515209	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.9	■■■□□ 2.86
LMAN2-208	ENST00000515209	INSR	P06213	1382 aa		32.89	■■■□□ 2.86
LMAN2-208	ENST00000515209	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
LMAN2-208	ENST00000515209	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.88	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.85	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.84	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.84	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.83	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.83	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.83	■■■□□ 2.85
LMAN2-208	ENST00000515209	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.82	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.81	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	DDB1	Q16531	1140 aa		32.8	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.79	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	IL2RB	P14784	551 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.77	■■■□□ 2.84
LMAN2-208	ENST00000515209	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	BCL9	O00512	1426 aa		32.75	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	MEGF6	O75095	1541 aa		32.73	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	EXOC5	O00471	708 aa		32.7	■■■□□ 2.83
LMAN2-208	ENST00000515209	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.68	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.66	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.66	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	TRIM37	O94972	964 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.64	■■■□□ 2.82
LMAN2-208	ENST00000515209	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
LMAN2-208	ENST00000515209	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.62	■■■□□ 2.81
LMAN2-208	ENST00000515209	RREB1	Q92766	1687 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LMAN2-208	ENST00000515209	EYA1	Q99502	592 aa		32.6	■■■□□ 2.81
LMAN2-208	ENST00000515209	BAG6	P46379	1132 aa		32.58	■■■□□ 2.81
LMAN2-208	ENST00000515209	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.57	■■■□□ 2.8
LMAN2-208	ENST00000515209	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.57	■■■□□ 2.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms