RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504398.1

AC008825.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC008825.1, Length 452 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008825.1-201ENST00000504398 EVA1CP58658 441 aa25.14■■□□□ 1.62
AC008825.1-201ENST00000504398 FLT4P35916 1363 aa25.14■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.14■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.13■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.13■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.12■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 COL18A1P39060 1754 aa25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 INSRP06213 1382 aa25.1■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 VPS72Q15906 364 aa25.1■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 LTN1O94822 1766 aa25.09■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 MTHFSP49914 203 aa25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
AC008825.1-201ENST00000504398 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.08■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 PPP2R1AP30153 589 aa25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ERBB3P21860 1342 aa25.07■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.06■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 STRN4Q9NRL3 753 aa25.06■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ATRNO75882 1429 aa25.05■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.05■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.04■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 ANP32CO43423 234 aa25.03■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.03■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CFAP53Q96M91 514 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 NRAPQ86VF7 1730 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 CRB1P82279 1406 aa25.02■■□□□ 1.6
AC008825.1-201ENST00000504398 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.01■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 PEAK1Q9H792 1746 aa25■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 RXRBP28702 533 aa24.99■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.99■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 POTEAQ6S8J7 498 aa24.98■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.98■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 BARGINQ6ZT62 677 aa24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 RGPD5Q99666 1765 aa24.97■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AC008825.1-201ENST00000504398 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 IL13P35225 146 aa24.94■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.92■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 NBPF4Q96M43 638 aa24.92■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 NUDCQ9Y266 331 aa24.92■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 EYA1Q99502 592 aa24.91■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 USP35Q9P2H5 1018 aa24.9■■□□□ 1.58
AC008825.1-201ENST00000504398 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.88■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 NCAPD2Q15021 1401 aa24.88■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 GLI3P10071 1580 aa24.88■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.86■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 IL2RBP14784 551 aa24.86■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.84■■□□□ 1.57
AC008825.1-201ENST00000504398 KDRP35968 1356 aa24.82■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 DISP2A7MBM2 1401 aa24.82■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.82■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 EXOC5O00471 708 aa24.8■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.8■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.79■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 A0A0G2JS52 829 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 FCHSD2O94868 740 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 MYT1Q01538 1121 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 DDB1Q16531 1140 aa24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.77■■□□□ 1.56
AC008825.1-201ENST00000504398 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.76■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 PDE3BQ13370 1112 aa24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.75■■□□□ 1.55
AC008825.1-201ENST00000504398 RGS12O14924 1447 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms