RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498834.5

VSTM2A-208, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2

Gene VSTM2A, Length 803 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-208ENST00000498834 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.07□□□□□ -0.8
VSTM2A-208ENST00000498834 MED14O60244 1454 aa10.06□□□□□ -0.8
VSTM2A-208ENST00000498834 COL9A1P20849 921 aa10.06□□□□□ -0.8
VSTM2A-208ENST00000498834 PLCB2Q00722 1185 aa10.06□□□□□ -0.8
VSTM2A-208ENST00000498834 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.06□□□□□ -0.8
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VSTM2A-208ENST00000498834 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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VSTM2A-208ENST00000498834 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 TECPR2O15040 1411 aa9.89□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 SLAIN2Q9P270 581 aa9.88□□□□□ -0.83
VSTM2A-208ENST00000498834 PNMA3Q9UL41 463 aa9.88□□□□□ -0.83
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