RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXO45P0C2W1 286 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 TIMP2P16035 220 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 ITPKCQ96DU7 683 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 NR1H3Q13133 447 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 BMP1P13497 986 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 MCM6Q14566 821 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 SENP2Q9HC62 589 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 ESPNB1AK53 854 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB15P59190 212 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM47Q96LD4 638 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-211ENST00000492895 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 IRF5Q13568 498 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF592Q92610 1267 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 KIFC2Q96AC6 838 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFP42Q96MM3 310 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 ABL2P42684 1182 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 FLIIQ13045 1269 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 SCARF1Q14162 830 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 UPP2O95045 317 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 CBLBQ13191 982 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 MEIOBQ8N635 442 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 Q6ZVU0 165 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC125Q86Z20 511 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 COG6Q9Y2V7 657 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 BMP2P12643 396 aa6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 VAC14Q08AM6 782 aa6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 WASHC4Q2M389 1173 aa6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF20Q5VTR2 975 aa6.35□□□□□ -1.39
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ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 POM121Q96HA1 1249 aa6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 CEP126Q9P2H0 1117 aa6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 RAD21O60216 631 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 LILRA1O75019 489 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM52Q96A61 297 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-211ENST00000492895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 WWC1Q8IX03 1113 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 CYLDQ9NQC7 956 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 NACADO15069 1562 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 ADH1AP07327 375 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 RELBQ01201 579 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SOBPA7XYQ1 873 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SPINT1O43278 529 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 MAN1A2O60476 641 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 ERVK-9P63128 1117 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SEMA3FQ13275 785 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SOX11P35716 441 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 PTGIRP43119 386 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 TTLL8A6PVC2 850 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 SCTRP47872 440 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-211ENST00000492895 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-211ENST00000492895 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-211ENST00000492895 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ANKRD28-211ENST00000492895 TREML4Q6UXN2 200 aa6.27□□□□□ -1.41
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