RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 EP400Q96L91 3159 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 USP35Q9P2H5 1018 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 EVA1CP58658 441 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 COG3Q96JB2 828 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 PANK3Q9H999 370 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRVP-202ENST00000490575 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 PEAK1Q9H792 1746 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 CRB1P82279 1406 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCC6O95255 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM182BQ5T319 152 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC7Q96M83 1385 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A0G2JS52 829 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 MYT1Q01538 1121 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 BARGINQ6ZT62 677 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 IP6K1Q92551 441 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ERBB3P21860 1342 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 HOXC9P31274 260 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC37A3O60309 1634 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 DISP2A7MBM2 1401 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRVP-202ENST00000490575 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 AMPHP49418 695 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 POLKQ9UBT6 870 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 RTL1A6NKG5 1358 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF4Q96M43 638 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 INSRP06213 1382 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 FLT4P35916 1363 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 PDE3BQ13370 1112 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 DDB1Q16531 1140 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 NSD2O96028 1365 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SBF2Q86WG5 1849 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRVP-202ENST00000490575 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MEGF6O75095 1541 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 MORC1Q86VD1 984 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TNS2Q63HR2 1409 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM37O94972 964 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 IL2RBP14784 551 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 EXOC5O00471 708 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC125Q86Z20 511 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRVP-202ENST00000490575 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NCAPD2Q15021 1401 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 EYA1Q99502 592 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNQ2O43526 872 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 BCL9O00512 1426 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MTHFSP49914 203 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 APBA3O96018 575 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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