RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489067.1

PRKCE-212, Transcript of protein kinase C epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCE, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCE-212ENST00000489067 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.55□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 DDB1Q16531 1140 aa13.54□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.54□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 CABP2Q9NPB3 220 aa13.53□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 USP6P35125 1406 aa13.53□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 PIK3C2AO00443 1686 aa13.53□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.53□□□□□ -0.24
PRKCE-212ENST00000489067 SYT17Q9BSW7 474 aa13.52□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.51□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 NLRP6P59044 892 aa13.51□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 TXNRD1Q16881 649 aa13.51□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 CABP1Q9NZU7 370 aa13.51□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.5□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 SLC15A2Q16348 729 aa13.5□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.5□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.49□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.49□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 PAPPAQ13219 1627 aa13.48□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 AKAP12Q02952 1782 aa13.48□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.47□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 RGPD5Q99666 1765 aa13.47□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 NFAT5O94916 1531 aa13.46□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 MTFR1LQ9H019 292 aa13.46□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 STK32BQ9NY57 414 aa13.46□□□□□ -0.25
PRKCE-212ENST00000489067 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.46□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.46□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 NHSQ6T4R5 1651 aa13.45□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 C1QTNF8P60827 252 aa13.45□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 MAP3K5Q99683 1374 aa13.45□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 KCNA4P22459 653 aa13.44□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.43□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 EXOC5O00471 708 aa13.43□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 TNS2Q63HR2 1409 aa13.43□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.42□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 ZNF827Q17R98 1081 aa13.42□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 ARXQ96QS3 562 aa13.42□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.42□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 ABCC6O95255 1503 aa13.41□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 CCDC7Q96M83 1385 aa13.41□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.41□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 SOX12O15370 315 aa13.4□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.4□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 ACSBG1Q96GR2 724 aa13.4□□□□□ -0.26
PRKCE-212ENST00000489067 AKT1S1Q96B36 256 aa13.39□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 CEP350Q5VT06 3117 aa13.38□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.38□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 CHD4Q14839 1912 aa13.38□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.38□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 BTAF1O14981 1849 aa13.37□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 USP54Q70EL1 1684 aa13.37□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 ERBB3P21860 1342 aa13.37□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 EVC2Q86UK5 1308 aa13.37□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.36□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 USP31Q70CQ4 1352 aa13.36□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.36□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.35□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.35□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.34□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 IFFO2Q5TF58 517 aa13.34□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.34□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.34□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
PRKCE-212ENST00000489067 IL2RBP14784 551 aa13.33□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 GPR162Q16538 588 aa13.33□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 KCNQ4P56696 695 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 NME9Q86XW9 330 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.31□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 NSD2O96028 1365 aa13.31□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 LTN1O94822 1766 aa13.3□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.29□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 LY75O60449 1722 aa13.28□□□□□ -0.28
PRKCE-212ENST00000489067 POLD1P28340 1107 aa13.26□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 KLHL34Q8N239 644 aa13.26□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.26□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.25□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
PRKCE-212ENST00000489067 IP6K1Q92551 441 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.5 ms