RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.77■□□□□ 0.28
NISCH-210ENST00000488157 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.77■□□□□ 0.28
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NISCH-210ENST00000488157 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.76■□□□□ 0.27
NISCH-210ENST00000488157 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NISCH-210ENST00000488157 CCDC7Q96M83 1385 aa16.76■□□□□ 0.27
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NISCH-210ENST00000488157 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.74■□□□□ 0.27
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NISCH-210ENST00000488157 NBPF4Q96M43 638 aa16.58■□□□□ 0.24
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NISCH-210ENST00000488157 LRRC37A3O60309 1634 aa16.58■□□□□ 0.24
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NISCH-210ENST00000488157 SHANK3Q9BYB0 1731 aa16.47■□□□□ 0.23
NISCH-210ENST00000488157 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NISCH-210ENST00000488157 NCAPD2Q15021 1401 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-210ENST00000488157 CCDC125Q86Z20 511 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-210ENST00000488157 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
NISCH-210ENST00000488157 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 IL13P35225 146 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-210ENST00000488157 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.44■□□□□ 0.22
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