RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C4-202ENST00000483873 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.61■■■■□ 3.45
GTF3C4-202ENST00000483873 EVA1CP58658 441 aa36.6■■■■□ 3.45
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCC6O95255 1503 aa36.59■■■■□ 3.45
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GTF3C4-202ENST00000483873 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.51■■■■□ 3.43
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GTF3C4-202ENST00000483873 PEAK1Q9H792 1746 aa36.44■■■■□ 3.42
GTF3C4-202ENST00000483873 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.43■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 ERBB3P21860 1342 aa36.41■■■■□ 3.42
GTF3C4-202ENST00000483873 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 AMPHP49418 695 aa36.4■■■■□ 3.42
GTF3C4-202ENST00000483873 HOXC9P31274 260 aa36.39■■■■□ 3.42
GTF3C4-202ENST00000483873 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
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GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.38■■■■□ 3.41
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GTF3C4-202ENST00000483873 RTL1A6NKG5 1358 aa36.36■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.36■■■■□ 3.41
GTF3C4-202ENST00000483873 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
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GTF3C4-202ENST00000483873 KIF24Q5T7B8 1368 aa36.26■■■■□ 3.4
GTF3C4-202ENST00000483873 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa36.26■■■■□ 3.4
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GTF3C4-202ENST00000483873 POLKQ9UBT6 870 aa36.25■■■■□ 3.39
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GTF3C4-202ENST00000483873 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
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GTF3C4-202ENST00000483873 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
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