RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FBLN1P23142 703 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STRN4Q9NRL3 753 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLKQ9UBT6 870 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HOXC9P31274 260 aa26.3■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABCC6O95255 1503 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATRNO75882 1429 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RTL1A6NKG5 1358 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL18A1P39060 1754 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FLT4P35916 1363 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 INSRP06213 1382 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RALBP1Q15311 655 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERBB3P21860 1342 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BARGINQ6ZT62 677 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CRB1P82279 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LTN1O94822 1766 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MTHFSP49914 203 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP35Q9P2H5 1018 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NRAPQ86VF7 1730 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPP2R1AP30153 589 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CFAP53Q96M91 514 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGPD5Q99666 1765 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBPF4Q96M43 638 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A0G2JS52 829 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYT1Q01538 1121 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GLI3P10071 1580 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EXOC5O00471 708 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IL2RBP14784 551 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EYA1Q99502 592 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUDCQ9Y266 331 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PEAK1Q9H792 1746 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IL13P35225 146 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PDE3BQ13370 1112 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ILDR2Q71H61 639 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANP32CO43423 234 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDB1Q16531 1140 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TATP17735 454 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGS12O14924 1447 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DISP2A7MBM2 1401 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NCAPD2Q15021 1401 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPG7Q9UQ90 795 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC125Q86Z20 511 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FCHSD2O94868 740 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDRP35968 1356 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms