RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470504.1

PTPRZ1-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRZ1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-204ENST00000470504 USP6P35125 1406 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 PIK3C2AO00443 1686 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 COL18A1P39060 1754 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 SPON1Q9HCB6 807 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 NLRP6P59044 892 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 CABP2Q9NPB3 220 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 CASZ1Q86V15 1759 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 RGPD5Q99666 1765 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 KCNQ2O43526 872 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 YY1P25490 414 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 DDB1Q16531 1140 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 PLSCR1O15162 318 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRZ1-204ENST00000470504 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 CABP1Q9NZU7 370 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 BCL9O00512 1426 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 EVC2Q86UK5 1308 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 ABCC6O95255 1503 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 MYOM1P52179 1685 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 NFAT5O94916 1531 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 TNS2Q63HR2 1409 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 CCDC7Q96M83 1385 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 NHSQ6T4R5 1651 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 USP54Q70EL1 1684 aa11.4□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 LTN1O94822 1766 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 EXOC5O00471 708 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 SOX12O15370 315 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 TXNRD1Q16881 649 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 PROM2Q8N271 834 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 STK32BQ9NY57 414 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 CHD4Q14839 1912 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZBTB7AO95365 584 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 BTAF1O14981 1849 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 SLC15A2Q16348 729 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 PAPPAQ13219 1627 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 PTGER2P43116 358 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 ERBB3P21860 1342 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 USP31Q70CQ4 1352 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 MTFR1LQ9H019 292 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRZ1-204ENST00000470504 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 IL2RBP14784 551 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 SYT17Q9BSW7 474 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 NME9Q86XW9 330 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 MAP3K5Q99683 1374 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 NEUROD1Q13562 356 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARXQ96QS3 562 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 TMC1Q8TDI8 760 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF827Q17R98 1081 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 A0A1W2PP64 1363 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 LY75O60449 1722 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRZ1-204ENST00000470504 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms