RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, human

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX21-208	ENST00000466252	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.66	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	GLI3	P10071	1580 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SNX21-208	ENST00000466252	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	LTN1	O94822	1766 aa		31.63	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	IP6K1	Q92551	441 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	ABCC6	O95255	1503 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SNX21-208	ENST00000466252	NSD2	O96028	1365 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	RGS12	O14924	1447 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	HOXC9	P31274	260 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	AMPH	P49418	695 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	CRB1	P82279	1406 aa		31.52	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
SNX21-208	ENST00000466252	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	ERBB3	P21860	1342 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	USP35	Q9P2H5	1018 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	SOCS7	O14512	581 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SNX21-208	ENST00000466252	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	INSR	P06213	1382 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	FLT4	P35916	1363 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
SNX21-208	ENST00000466252	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252		A0A0G2JS52	829 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	MYT1	Q01538	1121 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	DISP2	A7MBM2	1401 aa		31.32	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.61
SNX21-208	ENST00000466252	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	MTHFS	P49914	203 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.29	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
SNX21-208	ENST00000466252	IL2RB	P14784	551 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	PDE3B	Q13370	1112 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	DDB1	Q16531	1140 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	FAM182B	Q5T319	152 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	EYA1	Q99502	592 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	EXOC5	O00471	708 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SNX21-208	ENST00000466252	IL13	P35225	146 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	EP400	Q96L91	3159 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC125	Q86Z20	511 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SNX21-208	ENST00000466252	MEGF6	O75095	1541 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	RALBP1	Q15311	655 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	BCL9	O00512	1426 aa		31.07	■■■□□ 2.57
SNX21-208	ENST00000466252	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
SNX21-208	ENST00000466252	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.07	■■■□□ 2.56

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