RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 KCNQ2O43526 872 aa14.62□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 NUBP1P53384 320 aa14.62□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 PDE3BQ13370 1112 aa14.62□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 RGL3Q3MIN7 710 aa14.62□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.62□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 RREB1Q92766 1687 aa14.61□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.61□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.61□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.6□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 PIK3C2GO75747 1445 aa14.59□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 POGKQ9P215 609 aa14.59□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.59□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.58□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.58□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 ALS2Q96Q42 1657 aa14.58□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 SEC24BO95487 1268 aa14.57□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 STRN4Q9NRL3 753 aa14.57□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 EVA1CP58658 441 aa14.56□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 PRAM1Q96QH2 718 aa14.56□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 IFFO2Q5TF58 517 aa14.55□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 USP35Q9P2H5 1018 aa14.55□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.55□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 IER5LQ5T953 404 aa14.54□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 BARGINQ6ZT62 677 aa14.54□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.54□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 KIAA0232Q92628 1395 aa14.52□□□□□ -0.08
SOGA3-204ENST00000464495 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.52□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.52□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 IFNL1Q8IU54 200 aa14.51□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 DLC1Q96QB1 1528 aa14.51□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 C1QTNF8P60827 252 aa14.5□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 CHRNA2Q15822 529 aa14.5□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.5□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.49□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.49□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 SSH2Q76I76 1423 aa14.49□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.48□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 FAM212AQ96EL1 285 aa14.48□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 ATP7BP35670 1465 aa14.48□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 CHD4Q14839 1912 aa14.48□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.47□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 ITSN1Q15811 1721 aa14.47□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 PLSCR1O15162 318 aa14.47□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.46□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.46□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.46□□□□□ -0.09
SOGA3-204ENST00000464495 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 FKBP8Q14318 412 aa14.45□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 CASZ1Q86V15 1759 aa14.44□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 ZBTB7AO95365 584 aa14.43□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.43□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.43□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 MYOM1P52179 1685 aa14.42□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.42□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.42□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 STK32BQ9NY57 414 aa14.42□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.41□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 SYT17Q9BSW7 474 aa14.41□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 CPDO75976 1380 aa14.4□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 DDB1Q16531 1140 aa14.4□□□□□ -0.1
SOGA3-204ENST00000464495 PTGER2P43116 358 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 ABTB2Q8N961 1025 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 MTFR1LQ9H019 292 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 CRB1P82279 1406 aa14.39□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 SBF2Q86WG5 1849 aa14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 NLRP13Q86W25 1043 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 PEAK1Q9H792 1746 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 UTRNP46939 3433 aa14.37□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 ADGRB1O14514 1584 aa14.36□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 SLC15A2Q16348 729 aa14.36□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 GPR162Q16538 588 aa14.36□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SOGA3-204ENST00000464495 ARXQ96QS3 562 aa14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms