RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 ABCC6O95255 1503 aa28.43■■■□□ 2.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.42■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.42■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 STRN4Q9NRL3 753 aa28.41■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 FBLN1P23142 703 aa28.4■■■□□ 2.14
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
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RPUSD3-210ENST00000460909 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.38■■■□□ 2.13
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RPUSD3-210ENST00000460909 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.37■■■□□ 2.13
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RPUSD3-210ENST00000460909 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.35■■■□□ 2.13
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RPUSD3-210ENST00000460909 IP6K1Q92551 441 aa28.32■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.32■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 CRB1P82279 1406 aa28.32■■■□□ 2.12
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RPUSD3-210ENST00000460909 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.29■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 ERBB3P21860 1342 aa28.28■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 HOXC9P31274 260 aa28.28■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.28■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 PEAK1Q9H792 1746 aa28.28■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 USP35Q9P2H5 1018 aa28.27■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 RTL1A6NKG5 1358 aa28.26■■■□□ 2.12
RPUSD3-210ENST00000460909 BARGINQ6ZT62 677 aa28.26■■■□□ 2.11
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RPUSD3-210ENST00000460909 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.25■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.25■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.24■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.24■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.23■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.23■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 EP400Q96L91 3159 aa28.23■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.22■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 FLT4P35916 1363 aa28.21■■■□□ 2.11
RPUSD3-210ENST00000460909 POLKQ9UBT6 870 aa28.2■■■□□ 2.1
RPUSD3-210ENST00000460909 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.2■■■□□ 2.1
RPUSD3-210ENST00000460909 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
RPUSD3-210ENST00000460909 MORC1Q86VD1 984 aa28.19■■■□□ 2.1
RPUSD3-210ENST00000460909 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.19■■■□□ 2.1
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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RPUSD3-210ENST00000460909 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
RPUSD3-210ENST00000460909 LRRC37A3O60309 1634 aa28.1■■■□□ 2.09
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RPUSD3-210ENST00000460909 NBPF4Q96M43 638 aa28.09■■■□□ 2.09
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM182BQ5T319 152 aa28.05■■■□□ 2.08
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RPUSD3-210ENST00000460909 IL2RBP14784 551 aa28.03■■■□□ 2.08
RPUSD3-210ENST00000460909 PDE3BQ13370 1112 aa28.03■■■□□ 2.08
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RPUSD3-210ENST00000460909 IL13P35225 146 aa27.92■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 BCL9O00512 1426 aa27.92■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.9■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 PPP2R1AP30153 589 aa27.9■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.9■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 SBF2Q86WG5 1849 aa27.9■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
RPUSD3-210ENST00000460909 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
RPUSD3-210ENST00000460909 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
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