RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA32Q96LK8 384 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNK17Q96T54 332 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 NOD1Q9Y239 953 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.05□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 PRMT3O60678 531 aa7.04□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN10P78369 228 aa7.04□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.04□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 PTK2Q05397 1052 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 SIX5Q8N196 739 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.03□□□□□ -1.28
CBX1P4-201ENST00000439415 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 C21orf2O43822 256 aa7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC13P55735 322 aa7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 OCLNQ16625 522 aa7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 DKK1O94907 266 aa7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 EMP3P54852 163 aa7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP10Q9P2G4 905 aa7.01□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 CADPSQ9ULU8 1353 aa7□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPRNQ16849 979 aa7□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEB3A0JP26 581 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF40O75150 1001 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 CTHP32929 405 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEBQ6S5H4 581 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 BACH2Q9BYV9 841 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ECM1Q16610 540 aa6.98□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC102BQ68D86 513 aa6.98□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.98□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 JUNDP17535 347 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF2IP78347 998 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP4P98171 946 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM205CA6NFA0 338 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 SFI1A8K8P3 1242 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF14Q5TI25 921 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 BRICD5Q6PL45 260 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM32Q8TC27 787 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPT3Q9UH03 358 aa6.96□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 HINFPQ9BQA5 517 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR14Q9BWN1 585 aa6.95□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB33Q86T24 672 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.94□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 WEE1P30291 646 aa6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGAEP38570 1179 aa6.93□□□□□ -1.3
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