RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

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Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 HOXA2O43364 376 aa6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 SLF2Q8IX21 1173 aa6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.34□□□□□ -1.39
CYCSP43-201ENST00000438233 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 HRO43593 1189 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 LILRB3O75022 631 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 SLC10A3P09131 477 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NDUFV2P19404 249 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 MLECQ14165 292 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 IFFO2Q5TF58 517 aa6.33□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 APBB1O00213 710 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 TRAK2O60296 914 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 QPCTQ16769 361 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 Q6ZNB5 142 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NPATQ14207 1427 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.32□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 A0A0G2JS52 829 aa6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 FDX1P10109 184 aa6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 NECTIN2Q92692 538 aa6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 SYNMO15061 1565 aa6.31□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.3□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.3□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.3□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 SNRKQ9NRH2 765 aa6.3□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 COG6Q9Y2V7 657 aa6.3□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 DEPDC5O75140 1603 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 AP1G2O75843 785 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 CFHP08603 1231 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 HRCP23327 699 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 PTPRKQ15262 1439 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 POM121Q96HA1 1249 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ATP7AQ04656 1500 aa6.29□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 RNF40O75150 1001 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 USP17L8P0C7I0 530 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 MTMR2Q13614 643 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 IQGAP1P46940 1657 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 CPS1P31327 1500 aa6.28□□□□□ -1.4
CYCSP43-201ENST00000438233 ATP6V1AP38606 617 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 GUCA2AQ02747 115 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 FUT2Q10981 343 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 WWC1Q8IX03 1113 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 LRCH3Q96II8 777 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 ARID3AQ99856 593 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.27□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 HLA-CQ95604 372 aa6.26□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 PRR14Q9BWN1 585 aa6.26□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.26□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.25□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.25□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 AFAP1Q8N556 730 aa6.25□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 WNT2BQ93097 391 aa6.25□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 C6orf229H3BNL8 230 aa6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 HSPA1LP34931 641 aa6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 LAPTM4AQ15012 233 aa6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 MED14O60244 1454 aa6.23□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.23□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.23□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.23□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.23□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CYCSP43-201ENST00000438233 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.23□□□□□ -1.41
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