RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 SHPRHQ149N8 1683 aa13.3□□□□□ -0.28
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CD27-AS1-202ENST00000417058 STRN4Q9NRL3 753 aa13.12□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.12□□□□□ -0.31
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CD27-AS1-202ENST00000417058 PRKAR2BP31323 418 aa13.11□□□□□ -0.31
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CD27-AS1-202ENST00000417058 NGLY1Q96IV0 654 aa13.11□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.11□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.1□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.1□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.09□□□□□ -0.31
CD27-AS1-202ENST00000417058 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.09□□□□□ -0.31
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CD27-AS1-202ENST00000417058 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 USP21Q9UK80 565 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 AFF2P51816 1311 aa13.08□□□□□ -0.32
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.08□□□□□ -0.32
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