RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 COL18A1P39060 1754 aa34.51■■■■□ 3.12
CCZ1B-202ENST00000411858 NFAT5O94916 1531 aa34.51■■■■□ 3.12
CCZ1B-202ENST00000411858 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 USP54Q70EL1 1684 aa34.5■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 USP35Q9P2H5 1018 aa34.49■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.47■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.47■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.47■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM182BQ5T319 152 aa34.46■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 FYB1O15117 783 aa34.45■■■■□ 3.11
CCZ1B-202ENST00000411858 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 BARGINQ6ZT62 677 aa34.44■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.44■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 MYOM1P52179 1685 aa34.43■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.42■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 COG3Q96JB2 828 aa34.42■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 RGPD5Q99666 1765 aa34.41■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 FBLN1P23142 703 aa34.4■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.4■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.39■■■■□ 3.1
CCZ1B-202ENST00000411858 CRB1P82279 1406 aa34.38■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.38■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 DISP2A7MBM2 1401 aa34.37■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 BAG6P46379 1132 aa34.36■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 LRRC37A3O60309 1634 aa34.33■■■■□ 3.09
CCZ1B-202ENST00000411858 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.32■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.32■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCC6O95255 1503 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 IP6K1Q92551 441 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 LTN1O94822 1766 aa34.3■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.29■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.29■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.29■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 PEAK1Q9H792 1746 aa34.28■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 PANK3Q9H999 370 aa34.27■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 PDE3BQ13370 1112 aa34.26■■■■□ 3.08
CCZ1B-202ENST00000411858 ERBB3P21860 1342 aa34.26■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.25■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 TRIM37O94972 964 aa34.24■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 RREB1Q92766 1687 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 HOXC9P31274 260 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 SBF2Q86WG5 1849 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.22■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 AMPHP49418 695 aa34.21■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.21■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.21■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.2■■■■□ 3.07
CCZ1B-202ENST00000411858 LRP5O75197 1615 aa34.19■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC7Q96M83 1385 aa34.17■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.16■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.15■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 DDB1Q16531 1140 aa34.15■■■■□ 3.06
CCZ1B-202ENST00000411858 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.13■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 APBA3O96018 575 aa34.12■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 RTL1A6NKG5 1358 aa34.1■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.09■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.09■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.09■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 EXOC5O00471 708 aa34.08■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CCZ1B-202ENST00000411858 IL2RBP14784 551 aa34.05■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.04■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.04■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 BCL9O00512 1426 aa34.04■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 INSRP06213 1382 aa34.03■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.03■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 NBPF4Q96M43 638 aa34.03■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 POLKQ9UBT6 870 aa34.03■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 TNS2Q63HR2 1409 aa34.03■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 FLT4P35916 1363 aa34.02■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
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CCZ1B-202ENST00000411858 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.02■■■■□ 3.04
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
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CCZ1B-202ENST00000411858 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.98■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 NSD2O96028 1365 aa33.98■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa33.97■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.95■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.95■■■■□ 3.03
CCZ1B-202ENST00000411858 MORC1Q86VD1 984 aa33.94■■■■□ 3.02
CCZ1B-202ENST00000411858 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
CCZ1B-202ENST00000411858 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
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