RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-205ENST00000391970 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-205ENST00000391970 WNT7BP56706 349 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 SKOR1P84550 965 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 CDCA8Q53HL2 280 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 VRTNQ9H8Y1 702 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 USTQ9Y2C2 406 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRC-205ENST00000391970 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-205ENST00000391970 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-205ENST00000391970 EML3Q32P44 896 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRC-205ENST00000391970 USP17L10C9JJH3 530 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L12C9JPN9 530 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L11C9JVI0 530 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L21D6R901 530 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRC-205ENST00000391970 USP17L18D6R9N7 530 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-205ENST00000391970 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRC-205ENST00000391970 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 OGFOD1Q8N543 542 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 STK32AQ8WU08 396 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 NOD1Q9Y239 953 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 USP4Q13107 963 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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