RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTL1A6NKG5 1358 aa36.96■■■■□ 3.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 IP6K1Q92551 441 aa36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC10-202ENST00000380221 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.92■■■■□ 3.53e-10■■□□□ 11.7
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA0232Q92628 1395 aa36.9■■■■□ 3.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPDO75976 1380 aa36.88■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 AXIN2Q9Y2T1 843 aa36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHRNA2Q15822 529 aa36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL18A1P39060 1754 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGPD5Q99666 1765 aa36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.82■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMOX1P09601 288 aa36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSPA1LP34931 641 aa36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 EYA1Q99502 592 aa36.77■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC6O95255 1503 aa36.77■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.76■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 JCADQ9P266 1359 aa36.76■■■■□ 3.48
TRAPPC10-202ENST00000380221 FCHSD2O94868 740 aa36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.75■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 RUNDC1Q96C34 613 aa36.74■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM83GA6ND36 823 aa36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.73■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERBB3P21860 1342 aa36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKAR2BP31323 418 aa36.71■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.7■■■■□ 3.47
TRAPPC10-202ENST00000380221 APAF1O14727 1248 aa36.69■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 NBPF6Q5VWK0 638 aa36.69■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 NBPF4Q96M43 638 aa36.69■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAMTS2O95450 1211 aa36.68■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.67■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDRP35968 1356 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.63■■■■□ 3.46
TRAPPC10-202ENST00000380221 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.63■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 BTG4Q9NY30 223 aa36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.59■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.59■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEFMP07197 916 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEUROD2Q15784 382 aa36.58■■■■□ 3.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 STRN4Q9NRL3 753 aa36.57■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.56■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCAPD2Q15021 1401 aa36.56■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 EVA1CP58658 441 aa36.55■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.54■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMPOP42166 694 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRP6O75581 1613 aa36.53■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.51■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.51■■■■□ 3.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 NFE2L2Q16236 605 aa36.48■■■■□ 3.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIPK4P57078 832 aa36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 NGEFQ8N5V2 710 aa36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 C8orf37Q96NL8 207 aa36.46■■■■□ 3.43
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLIT2O94813 1529 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF521Q96K83 1311 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 WWC1Q8IX03 1113 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRAPQ86VF7 1730 aa36.43■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRB1P82279 1406 aa36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 DLG5Q8TDM6 1919 aa36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 NGLY1Q96IV0 654 aa36.42■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC27Q2M243 656 aa36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO41Q8TF61 875 aa36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP35Q9P2H5 1018 aa36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEGF6O75095 1541 aa36.38■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.37■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms