RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 FYB1O15117 783 aa37.46■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 GGNBP2Q9H3C7 697 aa37.45■■■■□ 3.59
TPGS1-201ENST00000359315 USP35Q9P2H5 1018 aa37.44■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 COG3Q96JB2 828 aa37.43■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 FBLN1P23142 703 aa37.42■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.41■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JS52 829 aa37.4■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 MYT1Q01538 1121 aa37.4■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 KIF7Q2M1P5 1343 aa37.38■■■■□ 3.58
TPGS1-201ENST00000359315 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa37.36■■■■□ 3.57
TPGS1-201ENST00000359315 CRB1P82279 1406 aa37.36■■■■□ 3.57
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC6O95255 1503 aa37.33■■■■□ 3.57
TPGS1-201ENST00000359315 PANK3Q9H999 370 aa37.33■■■■□ 3.57
TPGS1-201ENST00000359315 WDR17Q8IZU2 1322 aa37.33■■■■□ 3.57
TPGS1-201ENST00000359315 BRWD3Q6RI45 1802 aa37.32■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 TCP11L2Q8N4U5 519 aa37.32■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K19Q56UN5 1328 aa37.31■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa37.3■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 KIF20BQ96Q89 1820 aa37.3■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 BARGINQ6ZT62 677 aa37.29■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 KRT27Q7Z3Y8 459 aa37.29■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 LTN1O94822 1766 aa37.29■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 RGPD5Q99666 1765 aa37.28■■■■□ 3.56
TPGS1-201ENST00000359315 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa37.27■■■■□ 3.56
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM182BQ5T319 152 aa37.24■■■■□ 3.55
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TPGS1-201ENST00000359315 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.2■■■■□ 3.55
TPGS1-201ENST00000359315 HOXC9P31274 260 aa37.2■■■■□ 3.55
TPGS1-201ENST00000359315 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
TPGS1-201ENST00000359315 CARD10Q9BWT7 1032 aa37.19■■■■□ 3.54
TPGS1-201ENST00000359315 AMPHP49418 695 aa37.18■■■■□ 3.54
TPGS1-201ENST00000359315 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP2Q9NX02 1062 aa37.14■■■■□ 3.54
TPGS1-201ENST00000359315 RTL1A6NKG5 1358 aa37.14■■■■□ 3.54
TPGS1-201ENST00000359315 DISP2A7MBM2 1401 aa37.13■■■■□ 3.53
TPGS1-201ENST00000359315 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa37.13■■■■□ 3.53
TPGS1-201ENST00000359315 PEAK1Q9H792 1746 aa37.13■■■■□ 3.53
TPGS1-201ENST00000359315 EP400Q96L91 3159 aa37.12■■■■□ 3.53
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC37A3O60309 1634 aa37.1■■■■□ 3.53
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TPGS1-201ENST00000359315 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa37.07■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 WNK3Q9BYP7 1800 aa37.07■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 PDE3BQ13370 1112 aa37.06■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.05■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 NSD2O96028 1365 aa37.04■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 FLT4P35916 1363 aa37.04■■■■□ 3.52
TPGS1-201ENST00000359315 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
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TPGS1-201ENST00000359315 DEFB132Q7Z7B7 95 aa36.97■■■■□ 3.51
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF4Q96M43 638 aa36.97■■■■□ 3.51
TPGS1-201ENST00000359315 IL2RBP14784 551 aa36.96■■■■□ 3.51
TPGS1-201ENST00000359315 FAM196AQ6ZSG2 479 aa36.96■■■■□ 3.51
TPGS1-201ENST00000359315 MORC1Q86VD1 984 aa36.96■■■■□ 3.51
TPGS1-201ENST00000359315 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
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TPGS1-201ENST00000359315 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.95■■■■□ 3.51
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TPGS1-201ENST00000359315 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.92■■■■□ 3.5
TPGS1-201ENST00000359315 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.91■■■■□ 3.5
TPGS1-201ENST00000359315 EXOC5O00471 708 aa36.9■■■■□ 3.5
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TPGS1-201ENST00000359315 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.83■■■■□ 3.49
TPGS1-201ENST00000359315 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.82■■■■□ 3.48
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
TPGS1-201ENST00000359315 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.79■■■■□ 3.48
TPGS1-201ENST00000359315 NCAPD2Q15021 1401 aa36.79■■■■□ 3.48
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TPGS1-201ENST00000359315 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
TPGS1-201ENST00000359315 EYA1Q99502 592 aa36.79■■■■□ 3.48
TPGS1-201ENST00000359315 BCL9O00512 1426 aa36.78■■■■□ 3.48
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TPGS1-201ENST00000359315 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
TPGS1-201ENST00000359315 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa36.73■■■■□ 3.47
TPGS1-201ENST00000359315 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
TPGS1-201ENST00000359315 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
TPGS1-201ENST00000359315 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
TPGS1-201ENST00000359315 MTHFSP49914 203 aa36.7■■■■□ 3.47
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