RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGPD5Q99666 1765 aa23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUDCQ9Y266 331 aa23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL18A1P39060 1754 aa23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 IP6K1Q92551 441 aa23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 CPDO75976 1380 aa23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC6O95255 1503 aa23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIAA0232Q92628 1395 aa23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 FCHSD2O94868 740 aa23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20-201ENST00000316412 RUNDC1Q96C34 613 aa23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 EYA1Q99502 592 aa23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 HMOX1P09601 288 aa23■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHRNA2Q15822 529 aa22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 APAF1O14727 1248 aa22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 ILDR2Q71H61 639 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDRP35968 1356 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRKAR2BP31323 418 aa22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 JCADQ9P266 1359 aa22.95■■□□□ 1.27
PRAMEF20-201ENST00000316412 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERBB3P21860 1342 aa22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCAPD2Q15021 1401 aa22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF4Q96M43 638 aa22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM83GA6ND36 823 aa22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 NGEFQ8N5V2 710 aa22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF521Q96K83 1311 aa22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEFMP07197 916 aa22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEUROD2Q15784 382 aa22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC27Q2M243 656 aa22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NFE2L2Q16236 605 aa22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NRAPQ86VF7 1730 aa22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADAMTS2O95450 1211 aa22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 WWC1Q8IX03 1113 aa22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRP6O75581 1613 aa22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 BTG4Q9NY30 223 aa22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 RIPK4P57078 832 aa22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 PDE3BQ13370 1112 aa22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 EVA1CP58658 441 aa22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 STRN4Q9NRL3 753 aa22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLIT2O94813 1529 aa22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF20-201ENST00000316412 GOLGA2Q08379 1002 aa22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 CRB1P82279 1406 aa22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 WDR63Q8IWG1 891 aa22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 MEGF6O75095 1541 aa22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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