RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 IP6K1Q92551 441 aa29.51■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 IL13P35225 146 aa29.5■■■□□ 2.31
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CTU2-201ENST00000312060 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 RGPD5Q99666 1765 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 CPDO75976 1380 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0232Q92628 1395 aa29.45■■■□□ 2.3
CTU2-201ENST00000312060 COL18A1P39060 1754 aa29.44■■■□□ 2.3
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CTU2-201ENST00000312060 CHRNA2Q15822 529 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU2-201ENST00000312060 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU2-201ENST00000312060 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU2-201ENST00000312060 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU2-201ENST00000312060 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.4■■■□□ 2.3
CTU2-201ENST00000312060 ABCC6O95255 1503 aa29.38■■■□□ 2.29
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CTU2-201ENST00000312060 HMOX1P09601 288 aa29.36■■■□□ 2.29
CTU2-201ENST00000312060 RUNDC1Q96C34 613 aa29.36■■■□□ 2.29
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CTU2-201ENST00000312060 EYA1Q99502 592 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU2-201ENST00000312060 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.34■■■□□ 2.29
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CTU2-201ENST00000312060 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.34■■■□□ 2.29
CTU2-201ENST00000312060 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.33■■■□□ 2.29
CTU2-201ENST00000312060 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.33■■■□□ 2.29
CTU2-201ENST00000312060 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 FAM83GA6ND36 823 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 ERBB3P21860 1342 aa29.31■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 PRKAR2BP31323 418 aa29.3■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.3■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.3■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 APAF1O14727 1248 aa29.29■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 NEFMP07197 916 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 NBPF4Q96M43 638 aa29.28■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS2O95450 1211 aa29.27■■■□□ 2.28
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CTU2-201ENST00000312060 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.26■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.26■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.25■■■□□ 2.27
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CTU2-201ENST00000312060 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.23■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 BTG4Q9NY30 223 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 EVA1CP58658 441 aa29.21■■■□□ 2.27
CTU2-201ENST00000312060 NGEFQ8N5V2 710 aa29.2■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.19■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.19■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 NEUROD2Q15784 382 aa29.18■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 STRN4Q9NRL3 753 aa29.18■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 NCAPD2Q15021 1401 aa29.18■■■□□ 2.26
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CTU2-201ENST00000312060 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.15■■■□□ 2.26
CTU2-201ENST00000312060 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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CTU2-201ENST00000312060 NFE2L2Q16236 605 aa29.13■■■□□ 2.25
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CTU2-201ENST00000312060 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.1■■■□□ 2.25
CTU2-201ENST00000312060 NRAPQ86VF7 1730 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU2-201ENST00000312060 WWC1Q8IX03 1113 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU2-201ENST00000312060 C8orf37Q96NL8 207 aa29.09■■■□□ 2.25
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CTU2-201ENST00000312060 SLIT2O94813 1529 aa29.08■■■□□ 2.25
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CTU2-201ENST00000312060 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.08■■■□□ 2.25
CTU2-201ENST00000312060 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.07■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 PDE3BQ13370 1112 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA2Q08379 1002 aa29.02■■■□□ 2.24
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