RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000188417.1

Gm28718-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28718, Length 2,168 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ms4a1P19437 291 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Uspl1Q3ULM6 1089 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Neurod2Q62414 383 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Nxf2Q4ZGD8 691 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Taf3Q5HZG4 932 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ccdc38Q8CDN8 563 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Serpina10Q8R121 448 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Chd1lQ9CXF7 900 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 4930548H24RikQ9D496 437 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Trpm1Q2TV84 1622 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mx2Q9WVP9 655 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Arhgef11Q68FM7 1552 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Trpm2Q91YD4 1506 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mmp14P53690 582 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Lrriq3Q14DL3 633 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mkrn3Q60764 544 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tmx4Q8C0L0 335 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Chaf1aQ9QWF0 911 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Plb1Q3TTY0 1478 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Samd9lQ69Z37 1561 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Shroom2A2ALU4 1481 aa9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ccdc34Q3UI66 367 aa9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 SkilQ60665 675 aa9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cog6Q8R3I3 657 aa9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa9.49□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 E9Q0B3 247 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gpatch11Q3UFS4 262 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Olfml1Q8BSH2 233 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Golga2Q921M4 999 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Nphp4P59240 1425 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 BC005561E9Q5E2 1589 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 ErmnQ5EBJ4 281 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Vps33aQ9D2N9 598 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ttll5Q8CHB8 1328 aa9.48□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Znf608Q56A10 1511 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 EngaseQ8BX80 734 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Iqca1Q9CUL5 857 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 KdrP35918 1367 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Dot1lQ6XZL8 1540 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Trappc8E9PWG2 1437 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tulp1Q9Z273 543 aa9.47□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Setd1bQ8CFT2 1985 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cfap74Q3UY96 1578 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Klhl34A2AI76 644 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Sparcl1P70663 650 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Wwc1Q5SXA9 1104 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cetn4Q8K4K1 168 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 CenpqQ9CPQ5 267 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Creld2Q9CYA0 350 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zeb2Q9R0G7 1215 aa9.46□□□□□ -0.89
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Oas2E9Q9A9 742 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Adcy5P84309 1262 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gas2l2Q5SSG4 860 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cluap1Q8R3P7 413 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 MvpQ9EQK5 861 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Col17a1Q07563 1470 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 AU019823E9PUQ3 292 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Speer4f2E9Q366 295 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 RdxP26043 583 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zdhhc9P59268 364 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Trak1Q6PD31 939 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zfp397Q7TNK4 527 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 RbsnQ80Y56 783 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Fam177a1Q8BR63 207 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rsph6aQ8CDR2 708 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Stk25Q9Z2W1 426 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Psen1P49769 467 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Irx2P81066 474 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Oxsr1Q6P9R2 527 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Plin1Q8CGN5 517 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gpatch8A2A6A1 1505 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa9.44□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Wdr63B2RY71 923 aa9.43□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ercc3P49135 783 aa9.43□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa9.43□□□□□ -0.9
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Fam53cQ8BXQ8 393 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.4 ms