Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Psen1P49769 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Psen1P49769 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Psen1P49769 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Psen1P49769 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Psen1P49769 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Psen1P49769 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Psen1P49769 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Psen1P49769 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Psen1P49769 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Psen1P49769 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Psen1P49769 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Psen1P49769 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Psen1P49769 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Psen1P49769 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Psen1P49769 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psen1P49769 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Psen1P49769 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Psen1P49769 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Psen1P49769 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Psen1P49769 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psen1P49769 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Psen1P49769 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Psen1P49769 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Psen1P49769 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Psen1P49769 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Psen1P49769 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Psen1P49769 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Psen1P49769 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Psen1P49769 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Psen1P49769 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psen1P49769 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Psen1P49769 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Psen1P49769 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Psen1P49769 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psen1P49769 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Psen1P49769 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Psen1P49769 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Psen1P49769 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Psen1P49769 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Psen1P49769 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Psen1P49769 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Psen1P49769 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Psen1P49769 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Psen1P49769 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Psen1P49769 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Psen1P49769 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Psen1P49769 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Psen1P49769 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Psen1P49769 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Psen1P49769 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Psen1P49769 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Psen1P49769 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Psen1P49769 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Psen1P49769 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Psen1P49769 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Psen1P49769 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Psen1P49769 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psen1P49769 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Psen1P49769 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psen1P49769 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Psen1P49769 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Psen1P49769 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Psen1P49769 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Psen1P49769 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Psen1P49769 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psen1P49769 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psen1P49769 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psen1P49769 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psen1P49769 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Psen1P49769 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psen1P49769 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Psen1P49769 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Psen1P49769 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psen1P49769 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Psen1P49769 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psen1P49769 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Psen1P49769 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psen1P49769 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psen1P49769 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psen1P49769 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psen1P49769 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psen1P49769 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psen1P49769 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Psen1P49769 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psen1P49769 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psen1P49769 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psen1P49769 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psen1P49769 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Psen1P49769 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psen1P49769 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Psen1P49769 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Psen1P49769 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Psen1P49769 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psen1P49769 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Psen1P49769 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psen1P49769 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psen1P49769 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psen1P49769 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psen1P49769 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms