RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Col18a1P39061 1774 aa29,96■■■□□ 2,39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP29,95■■■□□ 2,39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stk31Q99MW1 1018 aa29,95■■■□□ 2,39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa29,95■■■□□ 2,39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Farp2Q91VS8 1065 aa29,94■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klhdc4Q921I2 584 aa29,94■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 CenpbP27790 599 aa29,94■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 CastP51125 788 aa29,93■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp7bQ64446 1462 aa29,93■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP29,93■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Snap23O09044 210 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Anp32aO35381 247 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 TimelessQ9R1X4 1197 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa29,92■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ciz1Q8VEH2 845 aa29,91■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atf3Q60765 181 aa29,91■■■□□ 2,38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29,9■■■□□ 2,38
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc60Q8C4J0 545 aa29,88■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm6268A2A3U9 297 aa29,87■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP29,87■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Supt16hQ920B9 1047 aa29,87■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcna6Q61923 529 aa29,86■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 TatQ8QZR1 454 aa29,86■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29,86■■■□□ 2,37
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf330Q922H9 316 aa29,83■■■□□ 2,37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam135bQ9DAI6 1403 aa29,83■■■□□ 2,37
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncoa4Q5U4H9 625 aa29,82■■■□□ 2,36
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Pibf1E9Q6K3 756 aa29,81■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gimap6Q8K349 305 aa29,81■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Amotl2Q8K371 772 aa29,8■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim58Q5NCC9 485 aa29,8■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dixdc1Q80Y83 711 aa29,8■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp16Q99LG0 825 aa29,8■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Iqcf3Q9D498 203 aa29,8■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa29,79■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ggnbp2Q5SV77 696 aa29,79■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnai1B2RSH2 354 aa29,76■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Robo1O89026 1612 aa29,76■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prim1P20664 417 aa29,76■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnai3Q9DC51 354 aa29,76■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP29,76■■■□□ 2,36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmco5bQ80X59 307 aa29,75■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nutm1Q8BHP2 1126 aa29,75■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wnk3Q80XP9 1757 aa29,74■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 NudcO35685 332 aaKnown RBP29,73■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vamp4O70480 141 aa29,73■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP29,73■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29,72■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnh5Q920E3 988 aa29,72■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptpn23Q6PB44 1692 aa29,71■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fmnl2A2APV2 1086 aa29,71■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Brinp3Q499E0 766 aa29,71■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa29,7■■■□□ 2,35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slit2Q9R1B9 1521 aa29,7■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29,7■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dbr1Q923B1 550 aa29,7■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Liat1Q810M6 228 aa29,69■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf521Q6KAS7 1311 aa29,69■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nsd3Q6P2L6 1439 aa29,68■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa29,67■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Armcx1Q9CX83 456 aa29,67■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP29,67■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 TnrQ8BYI9 1358 aa29,67■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam71e1A1L3C1 212 aa29,66■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyb5rlB1AS42 316 aa29,66■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm21698A0A087WQP8 267 aa29,65■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP29,65■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm21671G3UY31 267 aa29,65■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Siglec1Q62230 1695 aa29,65■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gli3Q61602 1583 aa29,65■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa29,65■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP29,64■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 HypkQ9CR41 129 aa29,64■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rlbp1Q9Z275 317 aa29,64■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aplp1Q03157 653 aa29,64■■■□□ 2,34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tet3Q8BG87 1668 aa29,63■■■□□ 2,33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rad17Q6NXW6 688 aa29,62■■■□□ 2,33
Suds3-201ENSMUST00000086471 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP29,62■■■□□ 2,33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3UPC7 1272 aa29,59■■■□□ 2,33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irx6Q9ER75 438 aa29,59■■■□□ 2,33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acsbg1Q99PU5 721 aa29,57■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10471E9Q1C7 252 aa29,56■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pak3Q61036 559 aa29,56■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arfgef2A2A5R2 1792 aa29,56■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trpm3Q5F4S9 1721 aa29,56■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa29,56■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm6aO70546 1401 aa29,56■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nkx2-3P97334 362 aa29,55■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aifm3Q3TY86 605 aa29,55■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttll13A4Q9F6 804 aa29,54■■■□□ 2,32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kif24Q6NWW5 1356 aa29,54■■■□□ 2,32
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