RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Col18a1P39061 1774 aa29.96■■■□□ 2.39
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa29.95■■■□□ 2.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Farp2Q91VS8 1065 aa29.94■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klhdc4Q921I2 584 aa29.94■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 CenpbP27790 599 aa29.94■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 CastP51125 788 aa29.93■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp7bQ64446 1462 aa29.93■■■□□ 2.38
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Anp32aO35381 247 aa29.92■■■□□ 2.38
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 TimelessQ9R1X4 1197 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa29.92■■■□□ 2.38
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc60Q8C4J0 545 aa29.88■■■□□ 2.37
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf330Q922H9 316 aa29.83■■■□□ 2.37
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Pibf1E9Q6K3 756 aa29.81■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gimap6Q8K349 305 aa29.81■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Amotl2Q8K371 772 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim58Q5NCC9 485 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dixdc1Q80Y83 711 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp16Q99LG0 825 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Iqcf3Q9D498 203 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa29.79■■■□□ 2.36
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnai1B2RSH2 354 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Robo1O89026 1612 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prim1P20664 417 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnai3Q9DC51 354 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Nutm1Q8BHP2 1126 aa29.75■■■□□ 2.35
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Suds3-201ENSMUST00000086471 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnh5Q920E3 988 aa29.72■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptpn23Q6PB44 1692 aa29.71■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fmnl2A2APV2 1086 aa29.71■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Brinp3Q499E0 766 aa29.71■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa29.7■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slit2Q9R1B9 1521 aa29.7■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29.7■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dbr1Q923B1 550 aa29.7■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Liat1Q810M6 228 aa29.69■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf521Q6KAS7 1311 aa29.69■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nsd3Q6P2L6 1439 aa29.68■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa29.67■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Armcx1Q9CX83 456 aa29.67■■■□□ 2.34
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Suds3-201ENSMUST00000086471 TnrQ8BYI9 1358 aa29.67■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam71e1A1L3C1 212 aa29.66■■■□□ 2.34
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm21671G3UY31 267 aa29.65■■■□□ 2.34
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Gli3Q61602 1583 aa29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa29.65■■■□□ 2.34
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Suds3-201ENSMUST00000086471 HypkQ9CR41 129 aa29.64■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rlbp1Q9Z275 317 aa29.64■■■□□ 2.34
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Suds3-201ENSMUST00000086471 Rad17Q6NXW6 688 aa29.62■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3UPC7 1272 aa29.59■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irx6Q9ER75 438 aa29.59■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acsbg1Q99PU5 721 aa29.57■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10471E9Q1C7 252 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pak3Q61036 559 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arfgef2A2A5R2 1792 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trpm3Q5F4S9 1721 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm6aO70546 1401 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nkx2-3P97334 362 aa29.55■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aifm3Q3TY86 605 aa29.55■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttll13A4Q9F6 804 aa29.54■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kif24Q6NWW5 1356 aa29.54■■■□□ 2.32
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