RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 GJC1P36383 396 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PFN3P60673 137 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 IL10RBQ08334 325 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CYP4F3Q08477 520 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 UGP2Q16851 508 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TMEM52BQ4KMG9 183 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 HES3Q5TGS1 186 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PARGQ86W56 976 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 OR4C6Q8NH72 309 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 IFT43Q96FT9 208 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 MYLKQ15746 1914 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 APC2O95996 2303 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ACACAQ13085 2346 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TSPAN11A1L157 253 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 MYO1FO00160 1098 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CSF2P04141 144 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TPM3P06753 285 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 C1SP09871 688 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 GIMD1P0DJR0 217 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 JUNDP17535 347 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SCNN1BP51168 640 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 THOP1P52888 689 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ELP6Q0PNE2 266 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 MMRN1Q13201 1228 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CAMK2BQ13554 666 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 KRT81Q14533 505 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 GRM3Q14832 879 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 IRF4Q15306 451 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TMCO4Q5TGY1 634 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TMPRSS12Q86WS5 348 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PROSER1Q86XN7 944 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 RBFAQ8N0V3 343 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 LZTR1Q8N653 840 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 NIPA2Q8N8Q9 360 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 LMX1AQ8TE12 382 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 NEMP2A6NFY4 417 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 A8MX80 341 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 H3BM21 787 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 K7ESM1 405 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SCAMP1O15126 338 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ALPPL2P10696 532 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 C6P13671 934 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ACP1P24666 158 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SERPINA4P29622 427 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 HNF1BP35680 557 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CSNK1DP48730 415 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 LIG3P49916 1009 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CDH6P55285 790 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 BCL2L1Q07817 233 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 C1orf61Q13536 156 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ERAP2Q6P179 960 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 RNF214Q8ND24 703 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TEKT4Q8WW24 435 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 APOLD1Q96LR9 279 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PACSIN1Q9BY11 444 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 TSPY26PQ9H489 355 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 SEPT3Q9UH03 358 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 NENFQ9UMX5 172 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 AQP9O43315 295 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 PCCBP05166 539 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CD48P09326 243 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 CDK4P11802 303 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-203ENST00000587752 MMP12P39900 470 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms