RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PLTP	P55058	493 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CDH17	Q12864	832 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT3	Q14435	633 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CST6	Q15828	149 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CRY1	Q16526	586 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	USP45	Q70EL2	814 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM63A	O94886	807 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SUN1	O94901	812 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PGLS	O95336	258 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	AGT	P01019	485 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	EPO	P01588	193 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CTSL	P07711	333 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	COL9A1	P20849	921 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	C5AR1	P21730	350 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ITGB7	P26010	798 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEA6	P43360	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GRIA4	P48058	902 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CCR3	P51677	355 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NEK3	P51956	506 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ARL4C	P56559	192 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SATB1	Q01826	763 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ERAP2	Q6P179	960 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MCU	Q8NE86	351 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	OMD	Q99983	421 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	DKK3	Q9UBP4	350 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TECTA	O75443	2155 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PQF6	199 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MID1	O15344	667 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	USP12	O75317	370 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TUBB	P07437	444 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MLN	P12872	115 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	AOC1	P19801	751 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	IVD	P26440	423 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SLC8A1	P32418	973 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	COPA	P53621	1224 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ELP6	Q0PNE2	266 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SEPT6	Q14141	434 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HIF1A	Q16665	826 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CENPU	Q71F23	418 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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