RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYMPP19971 482 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPOXP36551 454 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASPHQ12797 758 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRTP1Q5TC63 336 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD11Q693B1 232 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRGCQ6NXR0 463 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52K2Q8NGK3 314 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS39Q96JC1 886 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CABYRO75952 493 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB8P50452 374 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMED1Q13445 227 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM198Q66K66 360 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UROC1Q96N76 676 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.66■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIMK2P53671 638 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAGLUP54802 743 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRGQQ8WZA9 623 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIPK3Q9H422 1215 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLK1Q9UKI8 766 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP34Q70CQ2 3546 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR5O60602 858 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL2O95198 593 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AOC1P19801 751 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM189BP81408 668 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBX3Q13185 183 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MON1AQ86VX9 555 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAT9Q9BTE0 207 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPON2Q9BUD6 331 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CASS4Q9NQ75 786 aa15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRK2P25098 689 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABRB3P28472 473 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGSHP51688 502 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKX3-2P78367 333 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VN1R3Q9BXE9 311 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLOD4Q9HC38 313 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM233B4DJY2 109 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS56P0CW18 603 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARSAP15289 507 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT2P50583 147 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM60Q495X7 471 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR7D4Q8NG98 312 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD27Q96NW4 1050 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.64■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 G3V2L1 256 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLE2Q04725 743 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPF3Q92784 378 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB11Q96P15 392 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CATSPER2Q96P56 530 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH22Q9UJ99 828 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF711Q9Y462 761 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MUSKO15146 869 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEB3O15480 346 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM13O60858 407 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGNO95427 931 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF24P17028 368 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGAXP20702 1163 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRIA4P48058 902 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PKNOX1P55347 436 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSG1Q02413 1049 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNT3Q14435 633 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD6LQ8IWD5 586 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX31Q8N9S9 440 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSNARE1Q96NA8 513 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms