RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 MCM3P25205 808 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CHRNA3P32297 505 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PTPN7P35236 360 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CDKN2BP42772 138 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PSMD8P48556 350 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PEX5P50542 639 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 EPHB1P54762 984 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RHOAP61586 193 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAM193AP78312 1265 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BNC1Q01954 994 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IL10RBQ08334 325 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SEMA3BQ13214 749 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LLGL1Q15334 1064 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CST6Q15828 149 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CA9Q16790 459 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TREML4Q6UXN2 200 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BBS12Q6ZW61 710 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BNIPLQ7Z465 357 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PCGF5Q86SE9 256 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 STK40Q8N2I9 435 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PLD5Q8N7P1 536 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BBOF1Q8ND07 529 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KRT35Q92764 455 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 BIRC7Q96CA5 298 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IFT43Q96FT9 208 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PEBP4Q96S96 227 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 TLR10Q9BXR5 811 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IL21RQ9HBE5 538 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 AMACRQ9UHK6 382 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CDC23Q9UJX2 597 aa6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1B0GVT2 93 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 A0A1W2PQ67 120 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 FAM72CH0Y354 149 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PLK4O00444 970 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 NEMP1O14524 444 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 MATN3O15232 486 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 KCNN4O15554 427 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SH3BP5O60239 455 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GJB3O75712 270 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ANXA9O76027 345 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ECEL1O95672 775 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IL1BP01584 269 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 JCHAINP01591 159 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 IGHV4-34P06331 123 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CD48P09326 243 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RBP3P10745 1247 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SLC8A1P32418 973 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ADCY8P40145 1251 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 MMP13P45452 471 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 PLK1P53350 603 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 METAP1P53582 386 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SHC2P98077 582 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ZBTB16Q05516 673 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 CALCOCO2Q13137 446 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SERINC3Q13530 473 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 SNX1Q13596 522 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LAMB3Q13751 1172 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 DPYSQ14117 519 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 P3H1Q32P28 736 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 C5orf22Q49AR2 442 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 RAB6CQ53S08 254 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-205ENST00000467065 ALFQ53S48 1182 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms