RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PIRO00625 290 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SOCS2O14508 198 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 MPP1Q00013 466 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKCQQ04759 706 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CTBP1Q13363 440 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NXNL1Q96CM4 212 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC14AQ9UNH5 594 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.48■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NRP1O14786 923 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PGK1P00558 417 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FYNP06241 537 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HMOX2P30519 316 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NPY2RP49146 381 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PHEXP78562 749 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 REP15Q6BDI9 236 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP16Q9BY84 665 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC4Q9HBW1 653 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 INIPQ9NRY2 104 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D23Q9NUY8 699 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CD300AQ9UGN4 299 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ACOT9Q9Y305 439 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FBP2O00757 339 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TIPRLO75663 272 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP3P08254 477 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.554e-11■■■■■ 28.9
RALGPS1-208ENST00000424082 HDCP19113 662 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 STX5Q13190 355 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA3BQ13214 749 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 OSTM1Q86WC4 334 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 EFHD1Q9BUP0 239 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.47■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TSC2P49815 1807 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NEMP2A6NFY4 417 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ATE1O95260 518 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 JCHAINP01591 159 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NPR3P17342 541 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 HADHAP40939 763 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH17Q12864 832 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIK4Q16099 956 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF786Q8N393 782 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX31Q8N9S9 440 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR78Q96P69 363 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC2A13Q96QE2 648 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 AKAP10O43572 662 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP2P12643 396 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TKTL1P51854 596 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB15P59190 212 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PAQR9Q6ZVX9 377 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 USP33Q8TEY7 942 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 BORCS5Q969J3 196 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RALGPS1-208ENST00000424082 BRCA2P51587 3418 aa18.45■□□□□ 0.54
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.45■□□□□ 0.54
RALGPS1-208ENST00000424082 YJEFN3A6XGL0 299 aa18.45■□□□□ 0.54
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF839A8K0R7 811 aa18.45■□□□□ 0.54
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAO1P09471 354 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms