RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC63Q8NA47 563 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC41A2Q96JW4 573 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPZ1Q9BXG8 430 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GCM1Q9NP62 436 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHMP5Q9NZZ3 219 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CPA4Q9UI42 421 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CDY1Q9Y6F8 540 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SALL3Q9BXA9 1300 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LRRD1A4D1F6 860 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PGRMC2O15173 223 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RASAL1O95294 804 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GASTP01350 101 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HMGCRP04035 888 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FUCA1P04066 466 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CFIP05156 583 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NFICP08651 508 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FSTP19883 344 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB6AP20340 208 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 APEX1P27695 318 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CASQ1P31415 396 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ADMP35318 185 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ASIC1P78348 528 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRDNQ13061 729 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRE1Q14246 886 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 STK38Q15208 465 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FBLN7Q53RD9 439 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OLFML2BQ68BL8 750 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL35Q6PF15 583 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PAOXQ6QHF9 649 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CEP128Q6ZU80 1094 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GSTA5Q7RTV2 222 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA2013Q8IYS2 634 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KDM1BQ8NB78 822 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPFIBP2Q8ND30 876 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF480Q8WV37 535 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF653Q96CK0 615 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CALML4Q96GE6 196 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK16Q96T55 309 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PIM2Q9P1W9 311 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 USP18Q9UMW8 372 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRPV2Q9Y5S1 764 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DENND4AQ7Z401 1863 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8IPA6NC78 632 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PROM1O43490 865 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPP6R2O75170 966 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT10P13645 584 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRT13P13646 458 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GFAPP14136 432 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CYP3A7P24462 503 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ITPKBP27987 946 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IFNAR2P48551 515 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GALK1P51570 392 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPM6BQ13491 265 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GAMTQ14353 236 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC157Q569K6 752 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf136Q5SQH8 315 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TXNDC8Q6A555 127 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NEK5Q6P3R8 708 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GBP6Q6ZN66 633 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHST9Q7L1S5 443 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD4AQ8N468 514 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FRMD1Q8N878 549 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CTHRC1Q96CG8 243 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NUF2Q9BZD4 464 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IMPG2Q9BZV3 1241 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR26Q9H7D7 661 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POLD4Q9HCU8 107 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D23Q9NUY8 699 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HESX1Q9UBX0 185 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLIP2Q9UDT6 1046 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms