RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PPP1R36Q96LQ0 422 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 OLFM1Q99784 485 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.14■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 MROH6A6NGR9 719 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 H7C4K7 107 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 EPHA3P29320 983 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SMARCB1Q12824 385 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CUL3Q13618 768 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CSHL1Q14406 222 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SGF29Q96ES7 293 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF333Q96JL9 665 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 NUF2Q9BZD4 464 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.13■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TBC1D4O60343 1298 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 NPHS1O60500 1241 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 INHAP05111 366 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TACR2P21452 398 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 GPNMBQ14956 572 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ACAD11Q709F0 780 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SEMA3CQ99985 751 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 BATF3Q9NR55 127 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PRAMEF11O60813 436 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ZMPSTE24O75844 475 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ITGAXP20702 1163 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PBX3P40426 434 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ERFP50548 548 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PRAMEP78395 509 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PEX6Q13608 980 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 GALNT7Q86SF2 657 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 HDAC10Q969S8 669 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 POMKQ9H5K3 350 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 GPAMQ9HCL2 828 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.12■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 HTTP42858 3142 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CCL22O00626 93 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ACADSP16219 412 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ARSDP51689 593 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 EPHB1P54762 984 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 DNAJB13P59910 316 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 MTA1Q13330 715 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF235Q14590 738 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 STON2Q8WXE9 905 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 IFT43Q96FT9 208 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CDYLQ9Y232 598 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 F5H5T6 163 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 GJB3O75712 270 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SERPINB5P36952 375 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 KCNQ1P51787 676 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 AP2B1P63010 937 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 BFSP2Q13515 415 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 RNF135Q8IUD6 432 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 LGI2Q8N0V4 545 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXCL16-201ENST00000293778 CNDP1Q96KN2 507 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms