RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 TSSK4Q6SA08 328 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 TDRPQ86YL5 185 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 RNF183Q96D59 192 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 WDFY2Q96P53 400 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 STRA6Q9BX79 667 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 KAT14Q9H8E8 782 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.66□□□□□ -1.5
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SMARCA2-241ENST00000635397 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 COX11Q9Y6N1 276 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa5.65□□□□□ -1.5
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SMARCA2-241ENST00000635397 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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SMARCA2-241ENST00000635397 ACTN2P35609 894 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 RAD52P43351 418 aa5.65□□□□□ -1.5
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SMARCA2-241ENST00000635397 HDAC4P56524 1084 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 TMPRSS3P57727 454 aa5.65□□□□□ -1.5
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SMARCA2-241ENST00000635397 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 CHAF1BQ13112 559 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 CFAP58Q5T655 872 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 CES5AQ6NT32 575 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 CMTM3Q96MX0 182 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 ASAH2Q9NR71 780 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1W2PRG0 241 aa5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 SEC14L5O43304 696 aa5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 ATP2C2O75185 946 aa5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 CDAP32320 146 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 PRAMEP78395 509 aa5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 HSPB2Q16082 182 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 DUSP28Q4G0W2 176 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 DEF8Q6ZN54 512 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 SZRD1Q7Z422 152 aa5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 CALML4Q96GE6 196 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF333Q96JL9 665 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 SERINC2Q96SA4 455 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 YME1L1Q96TA2 773 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 CENPOQ9BU64 300 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 LHPPQ9H008 270 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 SH2D4AQ9H788 454 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.64□□□□□ -1.51
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SMARCA2-241ENST00000635397 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.64□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1W2PPC1 479 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 A6NNC1 897 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 AGAP14A8MT82 685 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 B4DLN1 442 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 KLRF2D3W0D1 207 aa5.63□□□□□ -1.51
SMARCA2-241ENST00000635397 ADAM10O14672 748 aa5.63□□□□□ -1.51
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