RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 K7ESM1 405 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DFFAO00273 331 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 AREL1O15033 823 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MUSKO15146 869 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 AQP9O43315 295 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN6O43657 245 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 OPA1O60313 960 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT-CO3P00414 261 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MPOP05164 745 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GIMD1P0DJR0 217 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 JUNDP17535 347 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DESP17661 470 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFAIP3P21580 790 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACP1P24666 158 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RABIFP47224 123 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGRP47804 291 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 THOP1P52888 689 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD51Q06609 339 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERINC3Q13530 473 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IRF4Q15306 451 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASIC2Q16515 512 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFAP58Q5T655 872 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GUSBP11Q6P575 273 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFI44Q8TCB0 444 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEBP4Q96S96 227 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTYH3Q9C0H2 523 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR27Q9NS67 375 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 U3KQA8 63 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEMP2A6NFY4 417 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DAPK3O43293 454 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP12O75317 370 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSO75390 466 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TM7SF2O76062 418 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSF2P04141 144 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCCBP05166 539 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK4P11802 303 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CKMT1AP12532 417 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKILP12757 684 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIMP2P16035 220 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFN3P60673 137 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GABREP78334 506 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ILKQ13418 452 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAMLD1Q13495 774 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYTH1Q15438 398 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PARP15Q460N3 678 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAXCQ5TGI0 409 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPK15Q8TD08 544 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB7BQ96AH8 199 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF653Q96CK0 615 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL12RB2Q99665 862 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYT11Q9BT88 431 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC61Q9BV99 259 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCG4Q9H172 646 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SP110Q9HB58 689 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.25□□□□□ -1.25
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