RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 VCX3BQ9H321 246 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 COQ10BQ9H8M1 238 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TMOD3Q9NYL9 352 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS18Q9P253 973 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKMY1Q9P2S6 941 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DSEQ9UL01 958 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.63□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1B0GWJ7 208 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ENO4A6NNW6 628 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KPNA7A9QM74 516 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF879B4DU55 563 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 E9PI62 339 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 H0YIN7 160 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OVOL3O00110 214 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PLSCR1O15162 318 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF185O15231 689 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NVLO15381 856 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CLDN3O15551 220 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TNFSF14O43557 240 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SSX5O60225 188 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CACNG3O60359 315 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF623O75123 536 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP6R2O75170 966 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MTX2O75431 263 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ABHD16AO95870 558 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MT-ATP6P00846 226 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KNG1P01042 644 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 VIPP01282 170 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CFIP05156 583 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PFKMP08237 780 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP2P08253 660 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CYC1P08574 325 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 UROSP10746 265 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA8P13928 327 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SELLP14151 372 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IL1R1P14778 569 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MYF6P23409 242 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AVPR2P30518 371 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CTNNB1P35222 781 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BMI1P35226 326 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FASLGP48023 281 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC8A3P57103 927 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OLR1P78380 273 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ROM1Q03395 351 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ABRQ12979 859 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BNIP1Q12981 228 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IL24Q13007 206 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CUL1Q13616 776 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 LAMB3Q13751 1172 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MAN2A1Q16706 1144 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HFEQ30201 348 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BTBD16Q32M84 506 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AARDQ4LEZ3 155 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 XKR3Q5GH77 459 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TTI2Q6NXR4 508 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 C8orf74Q6P047 294 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 Q6ZUG5 572 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RRM2BQ7LG56 351 aa3.62□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HAUS6Q7Z4H7 955 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms