RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 TAF12Q16514 161 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 FBXL22Q6P050 247 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 KDELC1Q6UW63 502 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CHST9Q7L1S5 443 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 GPATCH11Q8N954 259 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 USP33Q8TEY7 942 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PTPRN2Q92932 1015 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ACDQ96AP0 544 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SKA1Q96BD8 255 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 POM121Q96HA1 1249 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 NSL1Q96IY1 281 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 VPS39Q96JC1 886 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 FEM1CQ96JP0 617 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 MYRFLQ96LU7 910 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 NACA2Q9H009 215 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 HEY2Q9UBP5 337 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SEPT3Q9UH03 358 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1B0GVM2 712 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC189A1A4V9 331 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ILVBLA1L0T0 632 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 KRBA1A5PL33 1030 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PFDN6O15212 129 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PRAMEF11O60813 436 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TRIM13O60858 407 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PMPCBO75439 489 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 EFEMP2O95967 443 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PEX11BO96011 259 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SOD2P04179 222 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 C2P06681 752 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ADH1AP07327 375 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SERPINA6P08185 405 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 RALBP11234 206 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 STMN1P16949 149 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 LAG3P18627 525 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TACR2P21452 398 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CCND1P24385 295 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 NMBRP28336 390 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ELF1P32519 619 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PPM1AP35813 382 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ALDH1A3P47895 512 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SLC1A6P48664 564 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 GPR15P49685 360 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 RAB10P61026 200 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ITKQ08881 620 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF235Q14590 738 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 GPNMBQ14956 572 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 FSCBQ5H9T9 825 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 RTP2Q5QGT7 225 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 HECTD3Q5T447 861 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 MBLAC2Q68D91 279 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 KLC3Q6P597 504 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 RAPH1Q70E73 1250 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 C14orf80Q86SX3 495 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 CLEC14AQ86T13 490 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-243ENST00000488923 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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