RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 ADH1BP00325 375 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 APRTP07741 180 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 MLNP12872 115 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 HLA-EP13747 358 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 VPS41P49754 854 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 DGKEP52429 567 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CDK18Q07002 472 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 FZD5Q13467 585 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 KCNJ11Q14654 390 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ARMC12Q5T9G4 340 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 KDELC1Q6UW63 502 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CPT1BQ92523 772 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 IFT43Q96FT9 208 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ACOX2Q99424 681 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PPM1HQ9ULR3 514 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 WASF2Q9Y6W5 498 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CKAP5Q14008 2032 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 STK25O00506 426 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PGLSO95336 258 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 NDST3O95803 873 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 FGF1P05230 155 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 TNFRSF8P28908 595 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ADRA1AP35348 466 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RPL21P46778 160 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 GRIA4P48058 902 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CLCN5P51795 746 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 WNT3AP56704 352 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 GUCY2DQ02846 1103 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CBLBQ13191 982 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CFAP58Q5T655 872 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PRUNE1Q86TP1 453 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 STK40Q8N2I9 435 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 MRGPRX2Q96LB1 330 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 FAM129BQ96TA1 746 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 GORASP1Q9BQQ3 440 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 FOXQ1Q9C009 403 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 EPB41L5Q9HCM4 733 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 GDF3Q9NR23 364 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ANAPC5Q9UJX4 755 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 COL6A3P12111 3177 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PQF6 199 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 BNIP3LO60238 219 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 FZD6O60353 706 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ABCB7O75027 752 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PPFIA2O75334 1257 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PMPCBO75439 489 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 LEFTY1O75610 366 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ALDH1A2O94788 518 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RHOXF2BP0C7M4 288 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 C5AR1P21730 350 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ITGB7P26010 798 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 SLC7A5Q01650 507 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CDH17Q12864 832 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 LAMB3Q13751 1172 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CRY1Q16526 586 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ARSIQ5FYB1 569 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 FAXCQ5TGI0 409 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RANBP10Q6VN20 620 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ZNF366Q8N895 744 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 CHST14Q8NCH0 376 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 LRRN4CLQ8ND94 238 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 IPMKQ8NFU5 416 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 ART4Q93070 314 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RAB7BQ96AH8 199 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 TRIB3Q96RU7 358 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-208ENST00000481211 RHOXF2Q9BQY4 288 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms