RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGPRX2Q96LB1 330 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX37Q96LM6 180 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BIRC8Q96P09 236 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GBA3Q9H227 469 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 VCXQ9H320 206 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SOBPA7XYQ1 873 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NPHS1O60500 1241 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF4P08620 206 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 IL12AP29459 219 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HK2P52789 917 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBA2P53672 197 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CD300CQ08708 224 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PDK1Q15118 436 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CDO1Q16878 200 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ5Q5HYK3 327 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPMQ5VYY2 423 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM67Q6ZTA4 783 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SCD5Q86SK9 330 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPTC7Q8NI37 304 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CIDEBQ9UHD4 219 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa3.67□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MAFKO60675 156 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 VAPBO95292 243 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 H6PDO95479 791 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ME2P23368 584 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 WARSP23381 471 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A1P30825 629 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC1A2P43004 574 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIA4P48058 902 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD1P49961 510 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMC2Q13753 1193 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LCN8Q6JVE9 175 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DLG3Q92796 817 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A4AQ96JQ5 239 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 INPPL1O15357 1258 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LDB2O43679 373 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FUCA1P04066 466 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 YWHAQP27348 245 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAA2P54646 552 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAT1P54687 386 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MMEL1Q495T6 779 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MTX3Q5HYI7 312 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMCX2Q7L311 632 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PTERQ96BW5 349 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SGF29Q96ES7 293 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SPON1Q9HCB6 807 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF19AQ9NV58 838 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AIF1P55008 147 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 POLE2P56282 527 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3BP2P78314 561 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MPP1Q00013 466 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKAA1Q13131 559 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF460Q14592 562 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CNGA3Q16281 694 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF15Q66K64 600 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf111Q8N326 155 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX26Q8N6G2 289 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPFIBP2Q8ND30 876 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 L3HYPDHQ96EM0 354 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAIMQ9NVQ4 179 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms