RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CABYRO75952 493 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 DHFRP00374 187 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CKMT2P17540 419 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PCSK1P29120 753 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CAPGP40121 348 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 BCAP31P51572 246 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CYP4F8P98187 520 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C4orf19Q8IY42 314 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CPT1BQ92523 772 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 HAS1Q92839 578 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MMP19Q99542 508 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 IL22Q9GZX6 179 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SNX7Q9UNH6 387 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PDE10AQ9Y233 779 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 UBE2QL1A1L167 161 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FAM92AA1XBS5 289 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 STX11O75558 287 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 NTRK1P04629 796 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 STAG3L1P0CL83 205 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 AKAP5P24588 427 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CDH13P55290 713 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 RAB10P61026 200 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 BICRALQ6AI39 1079 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 AHSA2Q719I0 299 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PROSER1Q86XN7 944 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 AP3S1Q92572 193 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FAM50BQ9Y247 325 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GVG6 124 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 TP73O15350 636 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SH3BGRLO75368 114 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ITIH1P19827 911 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PRDX6P30041 224 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SCN1BQ07699 218 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PRKG2Q13237 762 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 DNASE1L3Q13609 305 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 COLEC12Q5KU26 742 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MASTLQ96GX5 879 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 USP21Q9UK80 565 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FBP2O00757 339 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 TADA2AO75478 443 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 BMP10O95393 424 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 UGT2B4P06133 528 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FMO4P31512 558 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 NOMO3P69849 1222 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 TUBA3CQ13748 450 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 GLYATQ6IB77 296 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MACC1Q6ZN28 852 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CNTD1Q8N815 330 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 LEMD2Q8NC56 503 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPW3 197 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 NTSR2O95665 410 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 RFX3P48380 749 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 HERC3Q15034 1050 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CUZD1Q86UP6 607 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CAPN10Q9HC96 672 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms