RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 INPP5DQ92835 1189 aa17.01■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SORT1Q99523 831 aa17.01■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 BTBD10Q9BSF8 475 aa17.01■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 VN1R3Q9BXE9 311 aa17.01■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 RAB10P61026 200 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SLC12A1Q13621 1099 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 LRRC49Q8IUZ0 686 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 IGSF21Q96ID5 467 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CLPTM1LQ96KA5 538 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 FAM161BQ96MY7 647 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CLSTN3Q9BQT9 956 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 RNF38Q9H0F5 515 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ATP13A1Q9HD20 1204 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 G3V2L1 256 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 EZRP15311 586 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CALB2P22676 271 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GRIA4P48058 902 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TSTD2Q5T7W7 516 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TEX9Q8N6V9 391 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 EFHBQ8N7U6 833 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 OR13C4Q8NGS5 318 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 NUDCD1Q96RS6 583 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 BEGAINQ9BUH8 593 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 IL37Q9NZH6 218 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PIGNO95427 931 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 KLKB1P03952 638 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ACRP10323 421 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PGM1P36871 562 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ACCSLQ4AC99 568 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 THTPAQ9BU02 230 aa17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 WASH4PA8MWX3 477 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 RHOCP08134 193 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 MMP2P08253 660 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PRSS56P0CW18 603 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 OXCT1P55809 520 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GNA12Q03113 381 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 IL10RBQ08334 325 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SPATA17Q96L03 361 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 FAM92AA1XBS5 289 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PHF21BQ96EK2 531 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 COG4Q9H9E3 785 aa16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GSC2O15499 205 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TBC1D4O60343 1298 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TSPAN8P19075 237 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SLC8A1P32418 973 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 RGRP47804 291 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 IDH3AP50213 366 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 DEFB103AP81534 67 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CDK18Q07002 472 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TWF1Q12792 350 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 DLG1Q12959 904 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PTPRRQ15256 657 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PARP15Q460N3 678 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 MAVSQ7Z434 540 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 NUF2Q9BZD4 464 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GPAMQ9HCL2 828 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PLK2Q9NYY3 685 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 DCXO43602 365 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 SERPINF2P08697 491 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 CCDC166P0CW27 439 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 FAM219BQ5XKK7 198 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.98■□□□□ 0.31
PKN3-201ENST00000291906 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms