RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

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Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 I6L893 689 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MOCS3O95396 460 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MT-CO1P00395 513 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 MT-CO3P00414 261 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 APOEP02649 317 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CDK4P11802 303 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PRLRP16471 622 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DGKAP23743 735 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC63Q05C16 580 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ILKQ13418 452 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 STILQ15468 1287 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DLG2Q15700 870 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TTI2Q6NXR4 508 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 GJB7Q6PEY0 223 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM110Q86TL2 294 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 IQCHQ86VS3 1027 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM69Q86WT6 500 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB106AQ8N104 65 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 OXR1Q8N573 874 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 FGF11Q92914 225 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ARRDC3Q96B67 414 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 SPAG5Q96R06 1193 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 PSMB7Q99436 277 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 FZD3Q9NPG1 666 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXD8-202ENST00000429017 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.72□□□□□ -1.33
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HOXD8-202ENST00000429017 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GVM2 712 aa6.71□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 BECN2A8MW95 431 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 K7ERQ8 282 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CAPN9O14815 690 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MCF2LO15068 1137 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC31A1O15431 190 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 SNAP91O60641 907 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC12A1Q13621 1099 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 STAT4Q14765 748 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF284Q2VY69 593 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 COX20Q5RI15 118 aa6.71□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TMC6Q7Z403 805 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.71□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.71□□□□□ -1.34
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HOXD8-202ENST00000429017 OR4C6Q8NH72 309 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 STK32AQ8WU08 396 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HIC2Q96JB3 615 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CPXM1Q96SM3 734 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RMND1Q9NWS8 449 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 COX16Q9P0S2 106 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DMTF1Q9Y222 760 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.71□□□□□ -1.34
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