RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419578.1

LINC01527-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1527, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01527, Length 1,997 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01527-201ENST00000419578 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 MAGEB16A2A368 324 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TISP43B9A030 160 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TPP1O14773 563 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 AIM2O14862 343 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 NPHS1O60500 1241 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 AVILO75366 819 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 IGHA2P01877 340 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TNNC2P02585 160 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 CCNA2P20248 432 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 IL10P22301 178 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PSMA3P25788 255 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PCSK6P29122 969 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SCNN1AP37088 669 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SERPINB10P48595 397 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PCYT1AP49585 367 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ENTPD1P49961 510 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 EFNA5P52803 228 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 THOP1P52888 689 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 CDH6P55285 790 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 IGBP1P78318 339 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 UGP2Q16851 508 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TRIM16LQ309B1 348 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 LIPMQ5VYY2 423 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 FIBCD1Q8N539 461 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ESX1Q8N693 406 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 GIPC2Q8TF65 315 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 CEP170P1Q96L14 293 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 RDH12Q96NR8 316 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PKP2Q99959 881 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 WDR70Q9NW82 654 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 SELENONQ9NZV5 590 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 KLF15Q9UIH9 416 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 RAD54BQ9Y620 910 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 H0YAE9 185 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ACOT8O14734 319 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 ZBTB39O15060 712 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 VAPBO95292 243 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 VNN1O95497 513 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 BCL10O95999 233 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 GH2P01242 217 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 GPIP06744 558 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PDGFRBP09619 1106 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 UMPSP11172 480 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 MIPP30301 263 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 LIMK2P53671 638 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 OGDHQ02218 1023 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 FOXM1Q08050 763 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 BMPR2Q13873 1038 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 XKR3Q5GH77 459 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 IL23RQ5VWK5 629 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC01527-201ENST00000419578 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms