RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 DEPDC7Q96QD5 511 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEH1Q9H213 219 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 USP29Q9HBJ7 922 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 NEU3Q9UQ49 428 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 KALRNO60229 2985 aa21.45■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 K7ESM1 405 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RAD51BO15315 384 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 AP1G1O43747 822 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 NEBLO76041 1014 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GP1BAP07359 652 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ATP1A3P13637 1013 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TLE3Q04726 772 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 FZD2Q14332 565 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PARGQ86W56 976 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PLPP6Q8IY26 295 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 U3KQA8 63 aa21.44■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RAMP2O60895 175 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CSF2P04141 144 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 MPOP05164 745 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC172P0C7W6 258 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 FERP16591 822 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RABIFP47224 123 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 LGMNQ99538 433 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ABCG4Q9H172 646 aa21.43■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD62A6NC57 917 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 H3BM21 787 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CCP110O43303 1012 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GABREP78334 506 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 SGCGQ13326 291 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 EFHC2Q5JST6 749 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PYROXD2Q8N2H3 581 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 IFI44Q8TCB0 444 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 MAPK15Q8TD08 544 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 MCEEQ96PE7 176 aa21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 IGLON5A6NGN9 336 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 FPGTO14772 594 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TEX33O43247 280 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TSPAN6O43657 245 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 KDELR3O43731 214 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 USP12O75317 370 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CSO75390 466 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 C1QL1O75973 258 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CXADRP78310 365 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 LSMEM2Q8N112 164 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 RAB7BQ96AH8 199 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 HIC2Q96JB3 615 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 CNPY3Q9BT09 278 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.41■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 NEMP1O14524 444 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 DXOO77932 396 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GSRP00390 522 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 EPHB2P29323 1055 aa21.4■■□□□ 1.02
SOCS1-201ENST00000332029 GKP32189 559 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms