RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PgcQ9D7R7 392 aa20.02■□□□□ 0.8
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RhojQ9ER71 214 aa20.02■□□□□ 0.8
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 9230113P08RikD3YWX3 137 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdh18E9Q9Q6 790 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr603L7N1Y4 312 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm6309L7N481 315 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2-Eb1P04230 264 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alas2P08680 587 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aldh3a1P47739 453 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 FerP70451 823 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prickle1Q3U5C7 832 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GmncQ3URY2 333 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Heatr9Q5QNV8 569 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pnpla8Q8K1N1 776 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acvr1cQ8K348 493 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ovca2Q9D7E3 225 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DcpsQ9DAR7 338 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ropn1Q9ESG2 212 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Osbpl8B9EJ86 889 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r103E9PWW0 856 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Per3O70361 1113 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Casp8O89110 480 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 IqcmQ149I8 489 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd300lgQ1ERP8 331 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hbq1bQ3U0A6 142 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gstt2Q61133 244 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abhd10Q6PE15 297 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ssx9Q6XAS3 170 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnajc15Q78YY6 149 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wasf2Q8BH43 497 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RhoqQ8R527 205 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pde6cQ91ZQ1 861 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tekt2Q922G7 430 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim7Q923T7 510 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CenpkQ9ESN5 271 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tdp2Q9JJX7 370 aa20.01■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr600E9PUN7 314 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc1a6O35544 561 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sept7O55131 436 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc2a4P14142 509 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fen1P39749 378 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sult1e1P49891 295 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pitx1P70314 315 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpinb6Q60854 378 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ProcrQ64695 242 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cntn4Q69Z26 1026 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q6GQU0 248 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NeproQ8R2U2 564 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CabyrQ9D424 453 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4930524N10RikQ9D519 233 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ten1Q9D7K2 161 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl5a1Q9JII2 230 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa20■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm7073E9QAS1 335 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tap1P21958 724 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stx2Q00262 289 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dyrk2Q5U4C9 599 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmgb4Q6P8W9 181 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Galnt10Q6P9S7 603 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zmpste24Q80W54 475 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wnt9aQ8R5M2 365 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alg14Q9D081 217 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RalbQ9JIW9 206 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adamts5Q9R001 930 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Shroom3Q9QXN0 1986 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cntnap3E9PY62 1287 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp780bE9Q2S6 806 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arfip1G5E8V9 373 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prkag1O54950 330 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01631 113 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ItgavP43406 1044 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mapkapk2P49138 386 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Csrp3P50462 194 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp607aQ3TQG9 686 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rxfp4Q7TQP4 414 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tecpr1Q80VP0 1166 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrif1Q8CDD9 755 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rmnd1Q8CI78 450 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim68Q8K243 485 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mark1Q8VHJ5 795 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lgals2Q9CQW5 130 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmd9Q9CR00 222 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il1rl2Q9ERS7 574 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Shcbp1Q9Z179 668 aa19.99■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nhsl2B1AXH1 854 aa19.98■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 C130060K24RikG3UWA8 416 aa19.98■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klf6O08584 283 aa19.98■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01668 110 aa19.98■□□□□ 0.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt6aP50446 553 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25 ms