RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC8A1P32418 973 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCG1P45844 678 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ADPRHP54922 357 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG3Q92685 438 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRN2Q92932 1015 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 NXPE2Q96DL1 559 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMB7Q99436 277 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM7Q9C029 511 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 E5RJQ4 531 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 LATO43561 262 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP104O60308 925 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 C1SP09871 688 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 DRD3P35462 400 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 METAP1P53582 386 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 NXPH1P58417 271 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ST8SIA6P61647 398 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2CBP62714 309 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2CAP67775 309 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A3Q01959 620 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 BNIP3Q12983 259 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R5EQ16537 467 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF6Q58WW2 860 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 APCDD1Q8J025 514 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 CARNMT1Q8N4J0 409 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 EID2Q8N6I1 236 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 MCEEQ96PE7 176 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ST7Q9NRC1 585 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RAI2Q9Y5P3 530 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC72A6NJI9 287 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGAVP06756 1048 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 JUPP14923 745 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 GOT1P17174 413 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RXRGP48443 463 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 NNTQ13423 1086 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 RTP5Q14D33 572 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 STK40Q8N2I9 435 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK9Q9BZ29 2069 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-216ENST00000628306 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM170AA1A519 330 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC188H7C350 402 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 VAV1P15498 845 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD8P48556 350 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 HES3Q5TGS1 186 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 POLNQ7Z5Q5 900 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT35Q92764 455 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 OMDQ99983 421 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GDF3Q9NR23 364 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR4O00206 839 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GLI1P08151 1106 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ECT2LQ008S8 904 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH18Q13634 790 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TAC4Q86UU9 113 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A14Q96JA4 679 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SERAC1Q96JX3 654 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CNPY3Q9BT09 278 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 YKT6O15498 198 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO21O94952 628 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK4P11802 303 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 C5AR1P21730 350 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PCK1P35558 622 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 OGDHQ02218 1023 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMG2Q02383 582 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.62■■□□□ 1.53
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